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单细胞测序的三种方式

对单细胞转录组测序而言,组织解离后的细胞悬液需要进行单细胞分离,并通过微量扩增引入barcode和nique molecular identifier (UMI)实现分子标记,最终构建成符合上机测序要求的单细胞转录组测序文库。...

2020-08-06
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R-ggpmisc|回归曲线添加回归方程,R2,方差表,香不香?

散点图绘制回归曲线很常用,那么添加上回归方程,P值,R2或者方差结果表等可以展示更量化的信息。

2020-08-06
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R-rbind.fill|列数不一致的多个数据集“智能”合并,Get!

Q:多个数据集,列数不一致,列名也不一致,如何按行合并,然后保留全部文件的变量并集呢?

2020-08-06
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miRBase物种名缩写

研究miRNA的同学们应该都听说过或者用过miRbase这个数据库(http://www.mirbase.org/)。里面提供了285个物种中已知的所有miRNA信息。还不知道miRNA为何物的同学们,赶紧去恶补一下--》MicroRNA 的结构、生物合成及功能《-...

na
2020-08-06
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MicroRNA 的结构、生物合成及功能

大多数miRNA位于mRNA宿主基因的内含子中,并共享调控元件、初级转录物,因此具有相似的表达模式。miRNA通过RNA聚合酶II被转录为名为pri-miRNA的初级转录产物,并包含5'端帽子和polyA尾巴。pri-miRNA在细胞核经过由RNa...

na
2020-08-06
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零代码差异表达分析——手把手带你GEO实战

上次给大家安利了一款神器,零代码差异表达分析, DESeq,limma,edgeR一网打尽,可能大家觉得那是纸上谈兵,demo数据有啥意思,要就来真格的。好的,那么今天就真枪实弹干一场。...

2020-08-06
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10x Genomics

10x Genomics成立于2012年,总部位于美国加利福尼亚州,是一家国际领先的基因组学综合解决方案开发商。这家公司在2015年推出了GemCode仪器,自此引起了业界的广泛关注。...

2020-08-06
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R编程之路_数据汇总(2)

这个函数的使用格式为:apply(X,MARGIN, FUN, ...)。它应用的数据类型是数组或矩阵,返回值类型由FUN函数结果的长度确定。

2020-08-06
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单细胞技术应用——生殖健康篇

精子的生成在时间和空间上有着复杂而有序的过程。现代社会男性生殖障碍的比例越来越高,而不育症的男性患上睾丸癌和前列腺癌的风险比正常男性更高[Guo J et al. Cell Stem Cell. 2017]。...

na
2020-08-05
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肿瘤新抗原突变负荷分析

今天跟大家分享的是七月份发表在Frontiers in Bioengineering and Biotechnology杂志(IF:3.644)上的一篇文章Characterization of Neoantigen Load Subgroups in Gynecologic and Breast Cancers,文章......

2020-08-05
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