可变剪接调控基因RBFOX1以2.7 million的长度超过之前文献报道的最长基因CNTNAP2 (智力语言损伤相关基因)。RBFOX1编码的蛋白倒不长，只有397个氨基酸，可见其内含子区特别长。...

今天和大家分享的是2020年3月发表在Nature genetics（IF：27.603)上的一篇文章Comprehensive molecular characterization of mitochondrial genomes in human cancers，作者使用pan-cancer研究的WGS和RNA-s......

在几乎所有模式植物转录组测序技术都做烂的今天，始终有一些植物因为种种原因鲜有问津。例如小麦，就像是开在奢侈品商场的黄焖鸡：有钱的人未必瞧得上，没钱的也压根就不会去光顾。不过这么多年过去了，总有那么几个祖传数据躺...

正文部分1、TCODE：NACE进入找到 输出控制条件对应的应用程序名字，如下图：找到 输出控制条件对应的应用程序名字，如下图：找到 输出控制条件对应的应用程序名字，如下图：...

forcats 这个包是用来处理因子的，是tidyverse包的核心，提供了处理分类变量的工具。

在上一篇文章中，作者曾写过过度处理批次效应的后果。这里可能会有些争议，他将对如何在不使用不知道具体原理的“批次效应矫正”工具的情况下处理批次效应给与一些建议。为什么要这么做？批次效应矫正工具真的那么糟糕吗？...

因为大多数研究都集中在肿瘤的内在致癌通路上，所以在肿瘤免疫微环境（TIME）中m6A甲基化的潜在作用仍然难以捉摸。在本文中，作者系统地研究了769例头颈部鳞状细胞癌（HNSCC；Cancer Genome Atlas [TCGA]，n = 499；GSE65858，n = 270）...

势能面扫描前需要用户对扫描坐标有一个明确的定义。在Gaussian 16的广义内坐标（GIC）功能出现之前，我们只能对一些简单的结构参数，如笛卡尔坐标、键长、键角、二面角做势能面扫描。GIC的出现让我们可以定义更加复杂的扫描...

DoRothEA是一种包含转录因子（TF）与其靶标相互作用的基因集资源。一个TF及其对应靶点的集合被定义为调节子（regulons）。DoRothEA regulons 收集了不同类型的证据，例如文献，ChIP-seq peaks，TF结合位点基序以及从基因表达推断相...

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0038071720301395