如下图所示,我目前对sce结构的理解是,围绕scRNA-seq的原始count数据,储存了4组相关信息
今天给大家介绍宾夕法尼亚大学Nancy R. Zhang教授等人发表在Nature Methods上的一篇文章 “SAVER: gene expression recovery for single-cell RNA sequencing”。大规模并行单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 的快速发展为...
这个问题是数据分析的一个基本问题:成本函数。作为分析人员,我们之所以对航班延误感兴趣,是因为对乘客来说代价高昂。在许多情况下,到达延迟更重要。在大多数情况下,迟到对乘客来说成本更高,因为这可能会打乱其下一阶段的旅...
《R数据科学》是一本很好的R学习教材,小编学习过程中,把作业题做了一下,今天给出第三章3.3[1]习题解答,仅供参考。如有误,可留言。
《R数据科学》是一本很好的R学习教材,这里给出第三章3.2.4[1]习题解答,仅供参考。如有误,望指正。
“Gene Structure View (Advanced)”这个功能可以说,也是一时兴起写出来的。开发的主要动机,还是发现师弟师妹在做的事情实在是太费时间精力。就这样,四五年过去了。直到现在,我仍然没搞懂,这个功能是怎么被大伙用起来的。...
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7886066/
从上面记录的运行时间来看,scale.data数据CPU的计算时间(63.273s)相比counts和data数据快了不少,这是因为默认的scale.data数据只有2000个基因。对所有基因scale之后再次测试scale.data数据,CPU的计算时间变成了235.689s,相...
英文标题:Chemoresistance Evolution in Triple-Negative Breast Cancer Delineated by Single-Cell Sequencing
不同于我们常见的polyA富集方法,号称全转录组测序的rRNA depletion建库对于实验的要求更高,并且在建库过程中引入的我们并不想分析的序列也更多。