现行主流的Droplet-based单细胞测序技术主要思路是一个磁珠捕获一个细胞置于油包水的腔室里完成添加标签、建库操作。但在磁珠捕获的过程会出现未捕获到细胞或者两个细胞的异常情况。这就需要我们在分析单细胞数据中...

空间组学技术正在提供一个新的视角。通过量化数十到数百个基因、转录物或蛋白质，空间组学能够在自然组织或细胞结构的背景下收集有价值的分子、细胞和微环境信息。...

如果有读者仔细看过RNA-seq结题报告，就会发现在定量分析以外通常还会有SNP和INDEL分析。目前，对人类测序数据找突变最常用的软件是GATK，除了速度慢以外，没有其他明显缺点（可以通过部署Spark提高速度；当然，如果有钱，可以购买Se...

它们输出的结果看起来相似，但实质上是不同的：在A1和A2中是文本类型，而A3和A4中是错误类型。从数据的对齐方式上也可以反映出来。

题目：A new thinking: extended application of genomic selection to screen multiomics data for development of novel hypoxia-immune biomarkers and target therapy of ...

seqtk在生信届被誉为序列处理的瑞士军刀，其出自生信大神李恒之手，李恒是SAMtools、BWA、MAQ等著名生信软件的核心作者。seqtk基于C语言编写的软件，运行速度极快，极大的提高工作效率。seqtk日常序列的处理包括，比如：fq转换为...

标题：The landscape of lncRNAs in Cydia pomonella provides insights into their signatures and potential roles in transcriptional regulation

deeptools是基于Python开发的一套工具，用于处理诸如RNA-seq, ChIP-seq, MNase-seq, ATAC-seq等高通量数据。工具主要用途：

与bedtools intersect类似，window 在A和B中搜索重叠的特征。

1.输出文件六个,前四个文件可以指定保存位置，后两个文件是跟输入的gtf文件保存在一个位置，并且都是以-o提供的前缀开头的