最新 最热

读《Single Cell Biomedicine》

闲暇时,在书库里面搜索的时候看到了这本书:Single Cell Biomedicine,也是Xiangdong Wang 老师参编的。这几年,王老师在单细胞领域可谓是笔耕不辍:

na
2021-10-12
0

为何辣椒让人感到灼热?2021年诺贝尔医学奖颁给了试图回答这个问题的科学家

这些看似“常识”的小问题,早已成为人们习以为常的事实,却隐藏着人体细胞与外部世界“温度和触觉”交互的秘密。而今年的诺贝尔医学奖,也颁发给了帮助我们回答这些看似简单的问题的科学家们。...

na
2021-10-12
0

晚期非小细胞肺癌肿瘤异质性和微环境的单细胞分析

肺癌是一种高度异质性的疾病。癌细胞和肿瘤微环境中的细胞共同决定了疾病的进展,以及对治疗的反应或逃避。作者为了绘制晚期非小细胞肺癌 (NSCLC) 中癌细胞的细胞类型特异性转录组图谱及其肿瘤微环境,通过单细胞 RNA 测...

na
2021-10-09
0

scATAC-seq2: scATAC-seq技术原理

之前的推文中,我们主要对scATAC-seq研究的科学问题作了简单的介绍。这篇推文主要介绍scATAC-seq的技术原理和发展历程。下面这张图选自SnapATAC这个R包的作者Rongxin Fang的github上分享的内容(https://github.com/r3fa...

2021-10-09
1

GSEA分析中的gmt格式文件如何自定义

在我前面的文章:clusterProfiler包进行KEGG,GO,GSEA富集分析,有介绍在GSEA分析中,在MSigDB(Molecular Signatures Database)数据库中定义了很多基因集,下载的基因集是gmt格式文件。下载的gmt格式文件,打开后可以看见是下面这...

2021-09-29
1

生信基础 | 人-小鼠基因之间的比较

通过多种转换方式,发现人的ENTREZID有3个无法找到对应的SYMBOL,NCBI上检索了一下,也没找到这3个基因。

2021-09-29
1

2022年科学突破奖,9人共获奖金1500万美元,mRNA 新冠疫苗2位奠基人获奖

9 月 9 日,2022 年科学突破奖获奖名单在美国旧金山公布。生命科学奖、物理学奖、数学奖分别授予 5 个项目共 9 位科学家,每个项目奖金金额为 300 万元。...

2021-09-17
1

CellChat 三部曲3:具有不同细胞类型成分的多个数据集的细胞通讯比较分析

此教程显示了如何将 CellChat 应用于具有不同细胞类型成分的多个数据集的比较分析。几乎所有的CellChat功能都可以应用。

2021-09-15
1

百迈客新品-植物空间转录组的机遇与挑战

继单细胞转录组学技术之后,空间转录组技术登上2020年Nature Methods 年度技术的封面,可以说空间转录组引领科研领域的主导风向标。

2021-09-15
0

使用Seurat和Velocyto估算RNA速率

此教程演示分析存储在Seurat对象中的RNA速率定量。参数基于RNA速率教程[1]。如果您在工作中使用Seurat,请引用:

na
2021-09-15
0