跨膜通道样(TMC)基因在人类癌症的癌变、增殖和细胞周期中至关重要。然而,TMCs的多组学特征及其在人类癌症预后和免疫治疗反应中的作用尚未被探讨。...
Unraveling tumor–immune heterogeneity in advanced ovarian cancer uncovers immunogenic effect of chemotherapy
细胞中的每一个变异过程都会在其基因组上留下印记。利用数学方法从人类癌症成千上万的体细胞突变中已确定超过40个碱基替换和10个基因组重排突变特征。目前研究人员对某些特征的突变过程有了深入的了解,突变过程与许多...
从一项临床 III 期试验鉴定的823个晚期肾细胞癌患者的分子亚型,与抗血管生成剂和检查点抑制剂的不同临床结果息息相关。
一致性聚类(Consensus Clustering)是一个能够确定数据集(微阵列基因表达)中可能聚类的数量和成员的方法。这种方法在癌症基因组学研究中广泛普及,用于发现新的疾病的分子亚型。...
神经胶质瘤是中枢神经系统中最常见的原发性肿瘤类型之一。先前的研究发现,巨噬细胞积极参与肿瘤的生长。
常见的单细胞轨迹研究方法包括拟时序分析及RNA 速率分析等,广泛应用于发育研究,干细胞分化及肿瘤微环境免疫细胞的动态变化研究等。
之前我们介绍了一项整合多维组学通路分析的工作ActivePathways,能够在多个数据集中识别到显著富集的通路,包括那些在单个数据集中不明显的通路。今天来介绍一下这个R包的使用方法和使用输出文件进行Cytoscape绘制网络图...
在单细胞的商业化测序平台中,来自10X genomics的测序数据占据了很大的份额。相信大家在平时的科研工作中对10X数据并不陌生, 而Cell Ranger软件作为由10X官方开发的配套分析软件,颇受欢迎。今天我们就给大家介绍一下这...
N6-甲基腺苷(m6A)被认为是最常见、最频繁和最保守的内部修饰。随着RNA去甲基化酶的鉴定和甲基化RNA测序的成熟,RNA甲基化已被确定为一种常见的现象,也是RNA转录、加工、剪接、稳定性和翻译的关键调控因子。...