最新 最热

这篇6+文章告诉你m6A生信分析还能这么做!

卵巢癌(OC)是所有妇科肿瘤中导致死亡的主要原因。N6-甲基腺苷(m6A)相关调控因子在包括OC在内的多种肿瘤中发挥重要作用。然而,m6A RNA甲基化调控因子的表达及其与预后的相关性仍在很大程度上尚不清楚。...

2022-03-29
1

6+免疫相关lncRNA特征构建!

NSCLC (非小细胞肺癌)患者的肿瘤突变负荷相对较高,意味着可以产生更多的新抗原,从而激活机体的免疫系统,产生抗肿瘤的T细胞应答。了解NSCLC患者T细胞特征并与临床结局关联,可以帮助提高免疫治疗的疗效。...

2022-03-29
0

14+!整合基因组图谱基于深度学习预测癌症依赖性!

全基因组功能缺失筛选揭示了癌细胞增殖所必需的基因,被称为癌症依赖性。将癌症的依赖性与癌细胞的分子组成或未经筛选的细胞系以及进一步与肿瘤联系起来仍然具有挑战性。...

2022-03-29
1

Nature子刊!肺癌四个阶段的单细胞转录图谱!

今天小编为大家带来一篇NC的单细胞经典范例文章,作者使用单细胞测序揭示了肺腺癌进展的四个阶段中细胞和分子水平的变化。文章题目为Deciphering cell lineage specification of human lung adenocarcinoma with singl...

2022-03-29
0

TCGA中的致癌信号通路

控制细胞周期进展、凋亡和细胞生长的信号通路中发生遗传改变是癌症的共同特征,但通路改变的程度、机制和共发生在不同的个体肿瘤和肿瘤类型之间是不同的。基于TCGA中9125例肿瘤的多组学数据分析了10个典型通路的改变机...

2022-03-29
1

震惊!这篇单基因泛癌刚刚发了27分!

CD40是一种共刺激细胞表面受体,CD40配体的相互作用通过增加肿瘤细胞的免疫原性细胞死亡(ICD)、APC激活、上调主要组织相容性复合体(MHC)分子的肿瘤免疫原性、促炎因子的产生、CD4和CD8 T细胞的共刺激介导抗肿瘤免疫应...

na
2022-03-29
0

跟着小鱼头学单细胞测序-零表达基因的妙用

在单细胞RNA表达数据中,通常我们会观察到大量的零值,也称为drop-out现象。常规的单细胞分析中,会在预处理中通过归一化或插补进行处理。这里小编给大家介绍一篇关于处理drop-out的文章,结果展示了drop-out与细胞异质性的...

2022-03-29
1

跟着小鱼头学单细胞测序-如何选择适合的scRNA测序方法

自从2009 年首篇关于scRNA-seq的文章发表以来,这项技术正在被广泛的采用。随着测序平台商业化的迅速发展和相关生物信息学方法的不断成熟,带来了很多生物医学领域新的发现。上期我们简单的介绍了scRNA-seq的背景和数据...

2022-03-29
1

Nature:分析2658例癌症样本的全基因组中非编码体细胞的driver

以往的大规模测序项目已经确定了许多公认的癌症基因,但大部分工作都集中在蛋白质编码基因的突变和拷贝数改变上,主要使用全外显子组测序和单核苷酸多态性阵列数据。全基因组测序使系统地调查非编码区域的潜在driver事件...

2022-03-29
1

选对基因,单基因单癌仍然可以发高分!

IL27在肿瘤免疫微环境中具有双重作用,既可以诱导免疫反应,又可以通过抑制免疫功能刺激肿瘤扩张。然而,IL27是否可以作为预测生存和免疫治疗反应的生物标志物尚不清楚。此外,IL27对肿瘤的双重作用机制尚不清楚。...

na
2022-03-29
0