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热点综述 | 按照分析套路,梳理一下癌症研究中的scRNA-seq计算方法...

scRNA-seq已广泛应用于癌症相关研究,单细胞分辨率的转录组分析能够定量检测肿瘤内细胞表型多样性的分子活性。这样的高维数据需要计算分析,以提取有关驱动癌症发展、发病机制和临床结果的细胞类型和状态的相关生物学信...

na
2022-04-01
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JGG发布帕金森模型小鼠单细胞脑图谱 | CNGBdb支撑发表科研成果解读

2021年2月,Journal of Genetics and Genomics在线发表了题为“Single cell brain atlas of Parkinson’s disease mouse model”的研究论文。首次报道了帕金森模型小鼠单细胞脑图谱,包含纹状体、中脑和小脑的4,6146个单...

2022-04-01
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Science Bulletin发布世界首个家猪脑组织单细胞转录组图谱 | CNGBdb支撑发表科研成果速递

近日,Science Bulletin杂志在线发表了题为“Single cell atlas of domestic pig cerebral cortex and hypothalamus”的研究论文,首次报道了家猪脑组织单细胞转录组图谱(包含额叶、顶叶、颞叶、枕叶和下丘脑的32,250个单...

2022-04-01
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Nature 子刊:13种scRNA-seq技术基准测评报告

scRNA-seq是表征样本中单个细胞转录组的主要技术,然而scRNA-seq技术间存在显著差异,每种技术都有其最适合的应用场景。来自西班牙、瑞典、英国、德国、澳大利亚等多国研究团队共同对13种scRNA-seq方法开展基准测评,相关...

2022-04-01
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空间转录组技术在肿瘤免疫治疗中的应用潜力

肿瘤内异质性对癌症患者的准确诊断和个性化治疗策略的制定提出了重大挑战。此外,这种异质性可能是治疗耐药性、疾病进展和癌症复发的基础。虽然免疫疗法可以获得很高的成功率,但选择压力加上肿瘤内部的动态进化推动耐药...

na
2022-04-01
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王炸组合『单细胞+空间转录组』的科研应用【2】:肝脏生理学/疾病

最近的技术进步使得在单个细胞中进行全基因组RNA分析成为可能,这种技术被称为单细胞转录组测序(scRNA-seq)。肝脏组织的scRNA-seq主要包括肝脏组织被解离,单细胞被捕获,RNA测序等工作流程。...

na
2022-04-01
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王炸组合『单细胞+空间转录组』的科研应用【1】:心血管发育/疾病

提到科研顶流,就不得不提单细胞转录组(scRNA-seq)和空间转录组(ST),两者组合能够获得组织中的细胞组成并还原其空间信息,从而更加精确的解析组织结构,在科研以及临床应用中具有重要的意义。...

na
2022-04-01
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科研“出圈”必备——空间组学技术

空间组学技术正在提供一个新的视角。通过量化数十到数百个基因、转录物或蛋白质,空间组学能够在自然组织或细胞结构的背景下收集有价值的分子、细胞和微环境信息。...

2022-04-01
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前沿综述 | 微生物群落单细胞转录组技术的进展和挑战

单细胞RNA-seq (scRNA-seq)作为一种流行的工具,通过提供单细胞中单核苷酸分辨率的所有转录本的列表来绘制真核细胞状态图。在过去的几年中,scRNA-seq在人和小鼠细胞中广泛应用并取得重大进展。然而,微生物学的绝大多数研...

na
2022-04-01
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前沿综述 | 单细胞-蛋白组分析技术及其应用

之前我们已经分享了很多关于单细胞转录组测序(scRNA-seq)的实验技术、分析方法、数据集等,那么以蛋白质组为目标的单细胞分析技术有哪些?它们有哪些应用?...

na
2022-04-01
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