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非编码RNA预测:rRNA

在往期文章基因组编码基因预测中介绍了CDS的预测,今天为大家介绍ncRNA的预测。由于ncRNA种类繁多,特征各异,缺少编码蛋白质的基因所具有的典型特征,现有的ncRNA预测软件一般专注于搜索单一种类的ncRNA,如tRNAScanSE搜索tRN...

2022-05-05
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高通量测序的分子实验基础:DNA提取与处理

关于DNA的分子生物学试验是生物信息学研究的第一步,也是整个流程的基础,DNA质量的好坏直接关系到后续测序分析的成败。

2022-05-05
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Nat. Genet. | 哺乳动物胚胎发生细胞轨迹的系统重建

本文介绍由美国华盛顿大学基因组科学系的Chengxiang Qiu和美国洛克菲勒大学Junyue Cao等人共同发表在 Nature Genetics 的研究成果:作者着手整合几个与小鼠原肠胚形成和器官形成相关的单细胞RNA序列数据集。此外,作者定...

2022-04-19
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scRNA-seq揭示了正常和高脂饮食喂养小鼠升主动脉的细胞异质性

升主动脉(Aorta ascendens)为主动脉与左心室交接的部分,始于第三肋间软骨下缘,并沿胸骨左半边上行。升主动脉有左冠状动脉和右冠状动脉两分支,供应心脏养分,之后主干会接至主动脉弓。...

na
2022-04-18
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综述-单细胞转录组学分析细胞通讯

细胞间通讯 (Cell–cell communication, CCC) 是受生化信号调节的细胞间相互作用,能够调节单个细胞的生命过程和细胞间关系。过去CCC 只能在由一种或两种细胞类型和少数几个基因组成的体外实验中进行研究。这样是很不...

2022-04-18
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单细胞转录分析揭示纤维化过敏性肺炎的细胞异质性

过敏性肺炎(Hypersensitivity pneumonitis, HP)是易感和致敏个体吸入多种抗原引起的肺泡炎症或间质纤维化的复杂综合征,可以分为纤维化和非纤维化 HP。纤维化过敏性肺炎(FHP) 是一种致命的间质性肺病,但与特发性肺纤维化( ...

na
2022-04-18
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单细胞测序揭示强直性脊柱炎患者 NK 细胞亚群的改变和细胞毒性分子水平的降低

强直性脊柱炎 (AS) 是脊柱关节炎 (SpA) 的一个分支,其特点是长期不明原因的风湿性炎症。目前的诊断系统倾向于将SpA分为两类:外周SpA(主要影响四肢,与银屑病、炎症性肠病或先前感染有关)和轴向SpA(主要影响脊柱,如AS)。文章使...

2022-04-18
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Q&A:在melt和dcast之间反复横跳

各位水友大家好,自从上一次发布了改版的推文说明之后,大喵和村长收到了很多水友的问题,我们也对这些问题进行了回复,希望能对大家R语言的学习有所帮助,在此先谢谢各位的支持!本期我们精心挑选了一位水友遇到的问题进行知识...

na
2022-04-14
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拜耳|小分子药物的历史及其在多种治疗方式中的价值

2021年是德国拜耳化学研究实验室成立125周年。大量著名的小分子药物,从阿司匹林到拜瑞妥,都诞生于这家实验室。

na
2022-04-13
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徐峻|人工智能与药物设计学:新范式探索 (2)

随着信息技术的不断发展,药物设计方法学的新概念、新方法和新思路持续更新,药物发现范式也与时俱进。人工智能作为新工具,已应用于药物发现过程的多个方面,引起了制药行业的高度关注,也带来了对药物发现科学理论和方法学的...

na
2022-04-13
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