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2021年1-2月ceRNA研究汇总

已知microRNA可以通过结合mRNA导致基因沉默,而ceRNA可以通过竞争性地结合microRNA来调节基因表达。ceRNA可以通过应答元件(microRNA response elements,MREs)与microRNA结合从而影响microRNA导致的基因沉默。如:miRNA可通...

na
2022-09-21
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单细胞测序技术如何领跑肿瘤的免疫治疗?

歌德曾说过,“一棵树上很难找到两片叶子形状完全一样”,同样的,每一个肿瘤细胞也具有各自的特征。肿瘤是恶性肿瘤细胞、免疫细胞和间质细胞的复杂混合物,通常具有较高程度的瘤内和瘤间异质性。肿瘤微环境(TME)由促肿瘤和抗...

2022-09-21
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NAR | 上交医学院余健秀课题组发表m6A最新研究成果

日前,上海交通大学医学院余健秀研究组在Nucleic Acids Research杂志上在线发表“SUMOylation of YTHDF2 promotes mRNA degradation and cancer progression by increasing its binding affinity with ......

2022-09-21
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通过单细胞分析支气管肺泡灌洗液区分COVID-19轻症和危重症

为了阐明先天性和适应性宿主免疫系统是如何恶化COVID-19免疫病理。本文使用单细胞RNA测序(scRNA-seq)结合T细胞受体测序(TCR-seq)和B细胞受体测序(BCR-seq)共同绘制了COVID-19肺炎的全面深度免疫图谱,分析了31例轻症或危重症...

na
2022-09-21
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三代测序与单细胞转录组

单细胞转录组测序通常是基于二代测序平台,具有相对较低的成本和高通量的优势。由于二代测序建库过程需要对cDNA进行打断,无法同时获得细胞标签和全长转录组数据,所以对单细胞转录本的变化知之甚少。而三代测序可以获得全...

2022-09-21
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单细胞测序&空间转录组测序“强强联手”揭示肠道发育

肠道是人体最大的屏障器官,与肠道微生物共生协调营养需求和免疫。多种相互关联的细胞类型构成了成熟的肠道及其不同的形态,但其发育的分子基础仍不清楚。来自牛津大学Simmons和Koohy教授团队通过单细胞测序联合空间转录...

2022-09-21
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细胞相互作用在单细胞转录组中的应用(一)

许多生物进程和细胞通讯息息相关,如胚胎发育,器官形成,癌症发生发展,炎症反应,药物作用和耐药研究等。当细胞不能正确地相互作用或不正确地解码分子信息时,就会引起疾病。因此,细胞间信号通路的鉴定和定量已成为跨不同学科进...

2022-09-21
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单细胞ATAC测序揭示人类精子发生过程中的细胞特异性转录调控与染色质可及性

1月12日,南通大学生殖医学研究院孙斐教授及其团队在《Human Molecular Genetics》期刊发表了人类精子发生过程中的单细胞ATAC测序最新进展,题为:Single cell ATAC-Seq reveals cell type-specific transcriptional regul...

2022-09-21
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NCB | 杨辉/周海波组开发新型基因表达动态示踪技术实时标记低表达基因和lncRNAs

在活细胞中实时监测内源基因活性对于研究基因的生物学功能及其表达水平至关重要。基因组中编码蛋白质的基因只有1%-2%,大部分为非编码RNA。其中lncRNAs(Long non-coding RNAs)具有非常重要的调控功能, 多达78% 的lncRNA...

2022-09-21
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单细胞多组学分析揭示人发育过程中的造血景观

在胚胎发育过程中,造血干细胞(HSCs)需要快速分化为成熟的血细胞。我们目前对胎儿造血干细胞和祖细胞(HSPC)的了解主要是通过小鼠和体外模型系统来推进的。关于人类发育过程中的造血调控仍不明确。...

2022-09-21
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