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mRNA和甲基化关联分析

我们知道一般基因启动子区域的超甲基化会导致下游基因转录受到抑制,从而使表达量下调。也就是一般启动子区域的甲基化水平跟下游基因的表达是成负相关的。...

2022-09-21
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【粉丝作业】火山图展示ChIP-Seq peak结果

今天有个公众号粉丝问了小编一个问题,他想用前面讲过的EnhancedVolcano这个R包去绘制火山图来展示ChIP-Seq peak结果。这可让小编眼前一亮,也感到相当的欣慰。学以致用,举一反三才是学习的最终目的。接下来我们来看看这...

na
2022-09-21
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【R语言】Biostrings序列处理函数

做生物信息学分析,免不了要跟DNA,RNA,蛋白序列打交道。前面给大家介绍过几种获取DNA反向互补序列的方法。

2022-09-21
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Nature|单细胞多组学绘制小鼠新皮质发育图谱

哺乳动物的大脑皮层具有着无与伦比的细胞类型多样性,为了维持皮质正常的分层与行使功能,这些细胞类型是在一系列严格约束下产生的;此外,随着皮质的发育,大量细胞还会经历细胞状态的转换。因此,研究支配皮质细胞类型的产生和...

na
2022-09-21
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Science Advances | 单细胞测序技术破译皮肤支架周围整体免疫微环境

植入体内的生物材料和设备具有广泛的临床应用,如组织再生和细胞移植。在细胞微环境的组成部分中,结构特征(宏观,微观和纳米特征)在指导细胞行为方面起着至关重要的作用。...

na
2022-09-21
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外泌体在肿瘤领域最新研究

外泌体(Exosome)是一种直径约30~100nm 的双层膜囊泡状结构小体,可由机体内多种细胞如免疫细胞、干细胞、心血管细胞、 网织红细胞、 血小板、 神经细胞和肿瘤细胞等主动分泌产生, 广泛分布于外周血、尿液、唾液、 乳汁、...

na
2022-09-21
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Annu. Rev. Immunol. |张泽民组综述单细胞技术解析肿瘤浸润免疫细胞新发现

肿瘤微环境具有高度异质性,深入理解肿瘤微环境特别是肿瘤浸润免疫细胞的特征,对探究肿瘤发生发展和免疫疗法的关键调控分子至关重要。近年来,单细胞转录组技术成为解析肿瘤微环境的有力武器,在相关研究中取得了一系列突破...

2022-09-21
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Nature Review|从基因表达解读细胞间的相互作用和交流

细胞之间的相互作用可以协调生物的发育,体内稳态和单细胞功能。当细胞不能正确地相互作用或不正确地解码分子信息时,疾病便随之而来。因此,细胞间信号通路的鉴定和定量已成为跨不同学科进行的常见分析。蛋白质-蛋白质相...

na
2022-09-21
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多组学分析揭示了多原发肺腺癌新辅助免疫治疗后的反应机制

多原发肺癌(Multiple primary lung cancer, MPLC)是一种具有独特诊断和治疗策略的肺癌亚型,虽然新辅助免疫治疗在早期非小细胞肺癌中显示可显著提高患者生存率,但仍然只有一小部分晚期疾病患者对免疫治疗有反应;此外,由于...

2022-09-21
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R优雅的进行统计分析(1) T_test

❝本节来介绍如何使用R语言来做数据统计分析,通过「rstati」包进行t-test,完全使用tidyverse体系进行数据清洗及可视化❞安装并加载R包package.list=c("tidyverse","rstatix","ggtext")for (package in package.list) {...

2022-09-21
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