单细胞测序主要包括以下四个步骤。其中非常关键的一点就是如何进行单细胞的捕获/分选,这是决定单细胞检测成本和通量的关键步骤。
细胞(cell)是生物体基本的结构和功能单位。除病毒之外的所有生物均由细胞所组成。一般来说生物体所有细胞中包含相同的遗传物质 DNA,但会进行不同的转录表达,最终分化为不同的细胞。这些细胞相互作用并扮演不同的角色,在更...
随着三代测序技术的发展,目前已经开发出多款适用于三代测序数据的比对软件,例如minimap2,ngmlr,blasr 等。
针对人基因组RNA-Seq,read跨越外显子,此时要使用支持切除read的软件,例如tophat2,升级的hisat2.而bowtie2则不行。下面我们可以来对比下。
DNA、RNA 和蛋白质是三种重要的生物大分子,传统的观念认为 DNA 携带着遗传信息,蛋白质是体现生物功能的分子,而 RNA 在这二者间起传递遗传信息的桥梁作用。随着新一代测序技术的发展,越来越多的生物基因组被测序出来,而且,...
在得到了一个物种的基因组序列之后,就可以开始对其序列进行分析了。序列分析主要包括结构基因组分析,功能基因组分析以及比较基因组分析几部分。通过对序列进行全面地分析,在基因组水平上了解一个物种的特点。序列分析主...
日报君 发自 凹非寺量子位 | 公众号 QbitAI大家好,今天是9月30日星期五,明天十一假期就来啦!赶紧来看看,今天科技圈都发生了哪些新鲜事?Apple Watch Ultra被曝果冻屏继上周发售后,号称“苹果最贵手表”的Apple Watch Ultra...
近年来单细胞测序得到了飞跃式的发展,其横向上扩展到其他层面,如用于表观基因组分析的单细胞亚硫酸盐测序,纵向上扩展到多个组学数据整合和其他信息的整合,如空间转录组。近日,《Briefings in Functional Genomics》发表了...
北京时间5月11日晚11时,同济大学医学院、附属东方医院章小清教授课题组和美国华盛顿大学医学院Azad Bonni教授课题组、普林斯顿大学Samuel Wang教授课题组联合在《自然》(Nature)杂志上在线发表题为《转录组谱系研究揭示...
大家好!今天给大家介绍一篇2022年2月发表在Cancer Science(IF:6.518)上的一篇文章。作者对GEO和TCGA数据集进行分析鉴定到CENPF对皮肤黑色素瘤发展和转移具有一定作用。...