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完成任意癌症的任意基因突变与否分组后的转录组测序的差异分析

如何找到somatic的突变信息的maf文件,仍然是从UCSC的XENA浏览器里面选择NSCLC的里面的LUAD数据集即可,这个是网页里面的鼠标点击操作。值得注意的是网页里面关于同一个癌症有两个跳转链接哦(其中一个带有GDC的前缀):...

2023-12-28
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初试Seurat的V5版本

虽然说我们安装了Seurat的V5版本,但是初次使用的时候加载就报错了,如下所示:

2023-12-26
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【知识】稀疏矩阵是否比密集矩阵更高效?

这里的效率高,应该是有前提的:当使用稀疏矩阵的存储格式(如CSR)时,计算效率更高。如果是普通的完整矩阵格式,实际上效率一样。

2023-12-01
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2023-12-01
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乳腺癌淋巴结转移的细胞异质性和转录组特征

文章标题:《Single-cell RNA sequencing reveals cell heterogeneity and transcriptome profile of breast cancer lymph node metastasis》

2023-11-28
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73. Set Matrix Zeroes

Given an m x n matrix. If an element is 0, set its entire row and column to 0. Do it in-place.

2023-11-18
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无监督学习的集成方法:相似性矩阵的聚类

在机器学习中,术语Ensemble指的是并行组合多个模型,这个想法是利用群体的智慧,在给出的最终答案上形成更好的共识。

2023-11-13
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深度学习:张量 介绍

虽然张量看起来是复杂的对象,但它们可以理解为向量和矩阵的集合。理解向量和矩阵对于理解张量至关重要。

2023-10-27
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单细胞基因组学揭示平滑肌细胞表型转换过程中的一种新的细胞状态

文章标题:《Single-Cell Genomics Reveals a Novel Cell State During Smooth Muscle Cell Phenotypic Switching and Potential Therapeutic Targets for Atherosclerosis in Mo...

2023-10-24
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旋转图像

给定一个 n × n 的二维矩阵 matrix 表示一个图像。请你将图像顺时针旋转 90 度。

2023-10-23
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