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单细胞类型注释工具singleR

目前用于单细胞类型鉴定的工具有很多,我们认为比较适合大众直接上手使用的软件就是singleR了。那么,singleR到底是如何实现细胞注释的呢?今天,我们就一起来详细了解一下singleR。...

2020-08-06
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R|timeROC-分析

Inverse Probability of Censoring Weighting (IPCW) estimation of Cumulative/Dynamic time-dependent ROC curve。

2020-08-06
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【位姿估计】开源|CVPR2020|基准标记|TopoTag鲁棒的、可伸缩的拓扑基准标记系统,实现单帧可靠、准确的位姿估计

基准标记在增强现实(AR)、机器人导航和相机与物体之间相对姿态的一般应用中发挥着重要的作用。本文引入了TopoTag——鲁棒的、可伸缩的拓扑基准标记系统,能够实现单帧图像的可靠、准确的位姿估计。TopoTag系统利用拓扑...

2020-06-19
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Garnett

Garnett工作流包含两个主要部分: 训练/获取分类器:下载现有分类器,或训练自己的分类器。为了训练分类器,Garnett解析一个marker文件,选择一组训练细胞,然后训练一个多项式分类器来区分细胞类型。 对细胞进行分类:接下来,Garne...

2020-06-16
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Python气象绘图教程(五)

1、figure中的figsize(控制画布大小)、dpi(图像解析度),在figure上添加子图

2020-06-09
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rpb2基因——真菌扩增子测序的另一种marker选择

上文FEMS综述——土壤微生物生态学的已知和未知中,提到了rpb2基因作为真菌扩增子测序的另一种marker选择。本文对rpb2进行说明。

2020-05-29
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echarts的tooltip 使用formatter后,图例小圆点不见了!

image.png根据数据动态显示 tooltip当没有优秀率和及格率的时候悬浮的时候不显示 tooltip图例marker 就是图例小圆点 tooltip: { trigger: "axis", formatter: function(params) { ......

2020-05-26
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matplotlib 入门使用指南

1. pyplot模块1.1. color的值blue1.2. Marker的值point marker1.3. LineStyles的值solid line style例子:'b' # blue markers with default shape'ro' # red circles'...

2020-04-07
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单细胞测序揭示皮肤伤口中成纤维细胞的异质性

不知不觉在单细胞转录组领域做知识分析也快两年了,很幸运聚集了五个小伙伴携手共进,我们承诺不间断更新5个月,把我们这两年的学习成果全部掏出来给大家,包括5个栏目:...

2020-03-30
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过滤不合格细胞和基因(数据质控很重要)

现在一起看看拿到表达矩阵后有一个很重要的质控过程,就是根据一些阈值来过滤不合格细胞和基因。、细胞的不合格很容易理解, 可能是那个细胞检测到的基因数量太少,或者太多,也许是那个细胞的文库大小异常,都是需要谨慎考虑...

2020-03-30
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