自然键轨道（natural bond orbital, NBO）理论是由Wisconsin大学的Frank Weinhold教授等人提出的一种分析分子体系电子结构的方法。目前的量子化学计算大多基于分子轨道理论，得到的分子轨道往往是离域在整个分子上，与传统的...

Claudin是细胞间紧密连接的骨架蛋白，参与维持紧密连接的各种功能，异常表达可破坏上皮细胞及内皮细胞的结构，导致其功能严重受损。Claudin-low型乳腺癌是一种侵袭性肿瘤，其特征是细胞连接的关键成分低表达，与间质和干细胞性...

http://campar.in.tum.de/Chair/HaukeHeibelGaussianDerivatives

Lewis结构是简单而且经典的概念，但有些结构不能仅被一个Lewis结构有效描述。此时可以画出多个Lewis结构式，表明实际分子是这些Lewis结构的杂合体。描述同一个实际分子的Lewis结构称为共振结构，这种用多个共振结构描述同...

寻找过渡态是研究化学反应机理中至关重要的步骤，但实际研究中，找过渡态往往不是一帆风顺。过渡态的结构优化对初始猜测十分敏感。过渡态是势能面上的一阶鞍点，是反应路径上的能量极大值点。而势能面扫描（《用高斯做势能面...

WFRT分析也可以用来衡量氢键的相对强度。在本例中，我们考察一下NH3与HF形成的氢键二聚体H3N: ··· H—F，其中NH3是质子受体，HF是质子给体。我们首先用DFT方法（这里采用的级别是B3LYP/def2TZVPP）对该二聚体进行几何构型优...

在前两篇推送中，我们介绍了定量的共振理论和EzReson的安装，从本篇开始，我们通过实例展示用EzReson程序进行化学共振分析的方法。

势能面扫描前需要用户对扫描坐标有一个明确的定义。在Gaussian 16的广义内坐标（GIC）功能出现之前，我们只能对一些简单的结构参数，如笛卡尔坐标、键长、键角、二面角做势能面扫描。GIC的出现让我们可以定义更加复杂的扫描...

势能面扫描是我们用Gaussian常做的计算，一般可以分为刚性扫描和柔性扫描。如果在柔性扫描中给定两个坐标，那么我们将会得到二维势能面。但是有时候我们只希望两个坐标同时变化得到一条势能曲线，这可以通过使用Gaussian中...

分子在电子态之间的跃迁是极其快速的过程（飞秒量级），比分子的振动周期（皮秒量级）快得多。因此，在电子态跃迁的瞬间，分子中原子核的运动可认为跟不上电子态的变化，分子的核间距保持不变，体现在势能面上就是垂直跃迁，如下图所示，这...