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转录组中的基因表达模式聚类分析

实验设计对于转录组数据的分析是非常重要的,对于常规的case/control实验设计,通过两组间的差异检验就可以得到不同条件下的差异基因;对于多组的实验设计,可以每两组之间进行差异分析,也可以通过annova的检验,得到差异基因。...

2020-05-08
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去除比对偏差 (remove mapping bias)

在做等位基因(allele)的研究中,其中一个重要的步骤就是去除比对偏差。 众所周知,人是二倍体生物,在染色体同样位置会有一对allele,一般情况下是纯合子(homozygous)状态;有时候其中一个allele发生变异(可以理解为一个SNP,寡...

2020-04-01
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单细胞测序揭示皮肤伤口中成纤维细胞的异质性

不知不觉在单细胞转录组领域做知识分析也快两年了,很幸运聚集了五个小伙伴携手共进,我们承诺不间断更新5个月,把我们这两年的学习成果全部掏出来给大家,包括5个栏目:...

2020-03-30
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基于star比对工具的单细胞转录组数据可变剪切流程来啦

我不知道哪个研究团队会率先开发出来融合基因流程,不过今天刷Twitter看到了Nathan Castro-Pacheco is presenting STARsolo-Quant, a method for quantifying isoform expression in scRNA-seq data的新闻,是美国生......

2020-03-30
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爱恨难分—癌症免疫治疗获得性抗性

每个人的时间精力有限,必须优先阅读相关文献,开设这个栏目也是希望为大家推荐高质量的单细胞相关文献。如果大家对单细胞转录组感兴趣可以关注一下,哪怕每天只学一点点,积土成山,积水成渊。...

2020-03-27
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CVPR 2020 | 深度视觉推理2.0:组合式目标指代理解

本文介绍的是CVPR 2020上收录的论文《Cops-Ref: A new Dataset and Task on Compositional Referring Expression Comprehension》(已开源),文章第一作者是香港大学的陈振方同学,这项工作是陈振方同学在澳大利亚阿德莱德...

2020-03-24
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返回非空值函数LastnonBlank的第2参数使用方法

第2参数是一个表达式,是对第一参数进行过滤的表达式。如果我们第二参数只写一个常数,则等同于返回列表的最大值,主要差异表现在汇总合计上。

2020-03-24
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Power Pivot取前几行函数TopN的用法及案例解释

我们从上面的求解中指定,倒数2名实际上有3个名额,但是2个名次的平均值的话只需要求2个值的平均值就可以。所以这里存在去重的概念,可以使用Values或者Distinct来对成绩这个字段来去重。...

2020-03-24
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一篇文章让你完全掌握Power Pivot中如何进行排名

使用在度量值里: 例如我们要求每天数量合计的排名。要求这个,肯定要涉及两个指标,一个是求和(Sum),一个是排名(RankX)。

2020-03-24
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Power Pivot实现Excel中Vlookup函数模糊查找功能

返回结果:1000。此写法类似于Max函数,只不过max返回的是标量,lastnonblank返回的是单行单列的表。

2020-03-24
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