做测序数据分析的时候经常需要将gff格式的注释文件转换成gtf格式的文件。今天小编就给大家介绍一个工具，gffread来实现这个目的。注意这个工具需要在linux或者mac操作系统上运行。...

做一项分析之前，我们首先要做的就是安装软件、配置环境，但很多时候，我们往往会遇到各种奇奇怪怪的报错，卡在这一环节上。"报错坑"这个专题会搜集一些我们平时安装软件过程中的"疑难杂症"，帮助大家踢开一个又一个绊脚石。...

如果我们要比较的两个vcf文件的参考基因组版本不一致，就需要使用CrossMap等软件进行参考基因组版本转换，然后里使用 SnpSift 软件的 Concordance 命令比较它们。其中CrossMap软件依赖pyBigWig，使用conda进行安装，代码如...

最近一段时间（本文写作于2020-07-10）geopandas与geoplot两个常用的GIS类Python库都进行了一系列较为重大的内容更新，新增了一些特性，本文就将针对其中比较实际的新特性进行介绍。...

今天，打开大蟒蛇(Anaconda Navigator)时，突然报了错 如下：

Conda作为使用最为广泛的数据科学环境管理工具，可以协助我们很方便的完成创建管理环境、下载安装第三方库、软件包等操作，但其在下载资源的过程中下载速度时常令人捉急，即使使用连接速度更快的国内镜像，也摆脱不了其单线...

假设你的conda安装目录是C:Anaconnda3,第一步你需要将该路径和C:Anaconda3Scripts添加到环境变量中去。 之后用文本编辑器打开C:Anacondda3Scriptsconda并添加如下命令即可 #!/usr/bin/env bash C:/Anaconda3/...

A、坐标轴在不设置时，会自动根据数据的大小进行最合适的展示（当然只是电脑认为最合适的），但没有坐标轴的名字，大多数时候需要定制坐标轴。

如果清华大学镜像源里面没有这个库，那么还是会从原来的镜像https://repo.anaconda.com/pkgs/main/里面下载。

但是使用它把测序数据fastq文件比对到参考基因组的fasta文件的时候，发现运行日志里面有一个很有趣的报错：