本文介绍由美国德克萨斯大学MD安德森癌症中心生物统计学系的Ziyi Li和Kim-Anh Do共同通讯发表在 Bioinformatics 的研究成果：为了更好地注释scRNA-seq 数据，发现新的细胞类型，作者开发了一种简单而有效的方法，结合自动编...

本文介绍由美国加州大学圣地亚哥分校生物工程系Nathan E. Lewis通讯发表在 Nature Communications 的研究成果：作者介绍了Tensor-cell2cell，这是一种基于张量分解的无监督方法，它通过同时说明细胞的多个阶段、状态或位置...

题目：A single-cell survey of cellular hierarchy in acute myeloid leukemia 发表期刊：Journal of Hematology & Oncology (IF:23.2) 发表年份：2020-09

免疫系统中主要包含两类淋巴细胞：B lymphocytes (B cells) 和 T lymphocytes (T cells)。B cells 和 T cells 的区别在于表达的 antigen receptor 的结构（structure），分别是B-cell receptor (BCR) 和 T-cell r......

问题：在多发性骨髓瘤（MM）中 NK 细胞的细胞毒性降低。潜在的分子机制尚不清楚。

上一篇讲了单个样本的单细胞标准分析流程，但是通常我们做实验不会只测一个样本的，这时候就需要把多个样本整合起来。

上次我们简单介绍了gt包的理念以及基本的用法，今天我们通过一个完整的示例详细说一下gt包的各种用法！

要判断经过k次变换后的开灯的数目，我们可以先计算对于每一个cell而言，在经历了k次变换后，仍然开灯的期望，最后将每一个cell的期望相加即可。

本部分选择2020年发表在Genome Med 中的单细胞文章（Single-cell transcriptome analysis of tumor and stromal compartments of pancreatic ductal adenocarcinoma primary tumors and meta...

文章：Comparison of single‑nucleus and single‑cell transcriptomes in hepatocellular carcinoma tissue.