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单细胞测序技术将彻底改变整个生物科学

今天介绍的是一篇单细胞综述,发表于2013年的Nature reviews genetics ,预测了如今单细胞技术的火热。文章题目是:Single-cell sequencing-based technologies will revolutionize whole-organism science。...

2020-03-30
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单细胞可以跟bulk转录组结合起来

当然了,人家院长只是为了吸引人才嘛,玩笑归玩笑,实际上bulk转录组还是有用处了,比如今天组会看到NC的这篇文献 June 2019 题目是Targeting enhancer switching overcomes non-genetic drug resistance in acute myeloid l...

2020-03-30
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猜一猜这个人类肺部器官单细胞研究会发在CNS吗

作者的亚群信息都在Table S2. Human lung cell cluster identities and their abundances in each dataset.分别是:

2020-03-30
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送你20篇单细胞数据挖掘文章

而且后面关于器官图谱的单细胞文章,或多或少会引用他们的数据,包括2019年8月发布的广西医科大学基因组与个体化医学研究中心莫曾南教授课题组的Bladders单细胞研究,如下:...

2020-03-30
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两个小鼠器官单细胞图谱

第一个是2018年2月 发表在Cell(《细胞》)杂志的,浙江大学郭国骥团队的研究成果。其课题组自主开发了一套完全国产化的Microwell-seq高通量单细胞测序平台,对来自小白鼠近50种器官组织的40余万个细胞进行了系统性的单细胞...

2020-03-30
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总说要挖掘单细胞公共数据,你先用起来可以吗?

链接是; https://www.nature.com/articles/s42255-019-0089-9

2020-03-30
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单细胞实战(三) Cell Ranger使用初探

然后利用Filezilla下载其中SRR7722937的R1、R2的html,打开看下

2020-03-27
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爱恨难分—癌症免疫治疗获得性抗性

每个人的时间精力有限,必须优先阅读相关文献,开设这个栏目也是希望为大家推荐高质量的单细胞相关文献。如果大家对单细胞转录组感兴趣可以关注一下,哪怕每天只学一点点,积土成山,积水成渊。...

2020-03-27
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scRNA-seq数据处理—demultiplexing

根据使用的protocol和完整pipeline中的的特定pipeline,demultiplexing的方式不同。我们所知道的最灵活的demultiplexing pipeline是zUMI,它可用于demultiplexing和大多数基于UMI的protocol的比对。对于Smartseq2或其他p...

2020-03-27
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头颈癌免疫状况研究

当你的才华还撑不起你的野心时,请潜下心来,脚踏实地,跟着我们慢慢进步。不知不觉在单细胞转录组领域做知识分析也快两年了,通过文献速递这个栏目很幸运聚集了一些小伙伴携手共进,一起成长。...

2020-03-27
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