今天分享的这篇文章2019年2月发表在期刊Immunity上，题为：Human Fetal TNF-α-Cytokine-Producing CD4+ Effector Memory T Cells Promote Intestinal Development and Mediate Inflammation Earl......

看新工艺的library 像看天书一样，多了很多内容，老驴打算挖个坑尝试去读一下lib 中每个表格所代表的意义及用途，今儿开篇。

当你的才华还撑不起你的野心时，请潜下心来，脚踏实地，跟着我们慢慢进步。不知不觉在单细胞转录组领域做知识分析也快两年了，通过文献速递这个栏目很幸运聚集了一些小伙伴携手共进，一起成长。...

细胞计数由检测到的唯一细胞条形码的数量确定。在基于液滴的实验方案中，细胞条形码存在于水凝胶中，并与单个细胞和裂解/反应混合物一起包裹在液滴中。虽然每个水凝胶都应该有一个与之相关的细胞条形码，但有时一个水凝胶...

《STA | 哐！一文打尽 SOCV / POCV》这个标题很打脸，因为没有transition variation 部分也没有moment 部分。最近在驴群讨论了Transition variation 部分，总结一下，感谢各位的无私输出。...

cell ranger是10X genomics公司提供的，专门用于分析10X 单细胞转录组数据的pipeline, 包含了原始数据拆分，表达定量，聚类分析等多个功能，本文主要介绍如何使用该软件来拆分原始数据。...

在传统的测序技术中，上机测序的样本是由多个细胞构成的，最后分析得出的结论也只是基于所有细胞的平均水平，但是我们知道细胞是具有异质性的，对于大脑等复杂组织而言，其细胞类型是多样的；对于肿瘤细胞而言，其细胞异质性更是尤...

近期，北京大学生命科学学院、北大-清华生命科学联合中心徐成冉课题组在《Molecular Metabolism》杂志上发表了题为“Characterizing pancreatic β-cell heterogeneity in the streptozotocin model by single-cell tr...

记录一下看过的文献。 这篇文章主要讲述了原始的三胚层在原肠胚形成时需要远端和近端精确到表观调控作用。 Fig1 主要介绍了小鼠原肠胚的表观遗传表达谱。热图表明外胚层、中胚层、中内胚层和胚外谱系的发育过程中差...

不知不觉在单细胞转录组领域做知识分析也快两年了，很幸运聚集了五个小伙伴携手共进，我们承诺不间断更新5个月，把我们这两年的学习成果全部掏出来给大家，包括5个栏目：...