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多发性骨髓瘤发展过程中肿瘤和免疫细胞的共同进化

左边是所有的病人样本,采用了很多技术:10xWGS, scRNA, Bulk RNA, WES, WGS。至少一个样本同时利用了scRNA-seq和10x Genomics linked-read whole-genome sequencing (10xWGS)

2021-05-20
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单细胞新药研发导论|| 解锁人体屏障

药物的发现、设计、开发和上市是一项极其复杂的科学和社会工程,在得到新化学实体之后,往往需要考虑药物的有效性、安全性和可成药性。其实,新药研发已经有比较成熟的管线了,总结近代新药研发的基本模式,梁贵柏先生在其《新...

2021-05-18
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跟着CELL学作图|1.火山图

这篇2020年发表在cell上关于新冠的组学文章里面有大量的生信内容。今天带大家复现其中的一个Supplemental Figure:火山图。

2021-04-21
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Nat. Methods | SAVER: 单细胞RNA测序的基因表达恢复

今天给大家介绍宾夕法尼亚大学Nancy R. Zhang教授等人发表在Nature Methods上的一篇文章 “SAVER: gene expression recovery for single-cell RNA sequencing”。大规模并行单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 的快速发展为...

2021-04-13
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【生信文献200篇】21 使用单细胞多组学探索TNBC病人的新辅助化疗疗效

英文标题:Chemoresistance Evolution in Triple-Negative Breast Cancer Delineated by Single-Cell Sequencing

2021-03-23
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单细胞测序揭示出cashmere山羊毛发周期中DP细胞的中间状态和功能

皮肤乳头细胞(DP细胞)在毛囊的发育中起着重要作用,但是关于DP干细胞在整个毛囊周期过渡过程中的分化和机制的知识仍然有限,尽管一些研究报道说DP细胞可能 在分化过程中处于中间细胞状态,具体细胞状态的分类和功能尚不清楚...

2021-03-10
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单细胞时代 || 细胞身份概念的演变

The evolving concept of cell identity in the single cell era

2021-03-10
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单细胞RNA-seq揭示TNBC的异质性(图表复现01)

后起之秀奔涌而至,欢迎大家在《生信技能树》的舞台分享自己的心得体会!(文末有惊喜)

2021-03-04
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一个信号pin出多个terminal会有什么后果

尽管会有这样的需求,但是强烈建议不要采用这样的方式。哪怕中间加个buffer,出两个不同的pin。

2021-02-19
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单细胞转录组分析揭示胚胎毛囊发育过程中的真皮、表皮细胞命运

本文分析方法比较简单,分析对象主要是E14.5,E16.5,P0小鼠皮肤细胞。选取的时间比较有代表性,分别是E13.5(诱导期)、E16.5(器官生成)胎儿小鼠和新生小鼠(细胞分化阶段,P0)的后层皮肤。分别对表皮、真皮细胞进行一套分析,伪时序细...

2021-02-12
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