最新 最热

K8s基于自定义指标实现自动扩容

基于自定义指标除了基于 CPU 和内存来进行自动扩缩容之外,我们还可以根据自定义的监控指标来进行。这个我们就需要使用 Prometheus Adapter,Prometheus 用于监控应用的负载和集群本身的各种指标,Prometheus Adapter 可以...

2020-06-12
0

scRNA_seq:单细胞转录组测序简介

在传统的测序技术中,上机测序的样本是由多个细胞构成的,最后分析得出的结论也只是基于所有细胞的平均水平,但是我们知道细胞是具有异质性的,对于大脑等复杂组织而言,其细胞类型是多样的;对于肿瘤细胞而言,其细胞异质性更是尤...

2020-05-08
1

fastx_toolkit:处理fasta/fastq文件的小工具

在NGS数据分析中,常常需要对fasta/fastq文件进行一些处理,fastx_toolkit是一款综合性的工具,提供了很多有用的功能,能够简单方便的处理序列文件。官网如下...

2020-05-08
0

使用fastp对NGS数据进行质量过滤

fastp是最近新出的一款NGS数据质量过滤工具,相比传统的QC工具,有两个主要特点,第一个就是运行速度快,第二个就是提供了质控前后数据详细统计结果。github地址如下...

2020-05-08
1

cutadapt去除adapter序列

对于NGS数据分析而言,第一步都是进行质量控制,质量控制包括去除adapter序列,去除低质量序列等内容。在文库构建阶段,为了能够上机测序,会在插入片段两端添加adapter序列。当测序读长超过了插入片段长度时,就会读取到adapter...

2020-05-08
0

划重点|ATAC的peak shift需要这样做

ATAC使用Tn5转座酶来完成文库的构建工作,Tn5转座酶在连接adapter序列时,会存在9bp的gap,如下图所示

2020-05-07
1

最近大火的ATAC, 究竟是干什么的

名字很长,翻译为转座酶可及的染色质区域的高通量测序。在这个冗长的名字中,高通量测序我们一点都不陌生,NGS二代测序已经发展了这么多年,各种组学技术,比如WES, WGS, RNA_seq等等,应用非常广泛。那么”转座酶可及的染色质区...

2020-05-07
1

6.图图谈设计模式_适配器模式_java

有兴趣的可以手敲一下,亲手体会会有不一样的效果,下次见!感谢支持。~(^o^)/~

2020-04-10
0

科普:USB 4全面解读

USB4 全名为Universal Serial Bus Generation 4。USB 这个介面在1996 年发布USB 1.0 规格, 传输速度支援低速1.5 Mbps 与全速12 Mbps,以及之后陆续发表支援速度480 Mbps、5Gbps、10Gbps、20Gbps 等,并在2019年9 月发布...

2020-03-12
0

深入理解JavaScript系列(39):设计模式之适配器模式

适配器模式(Adapter)是将一个类(对象)的接口(方法或属性)转化成客户希望的另外一个接口(方法或属性),适配器模式使得原本由于接口不兼容而不能一起工作的那些类(对象)可以一些工作。速成包装器(wrapper)。...

2019-12-31
1