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生信技能树 R语言入门 第一周总结

因为自己之前学习过一部分B站生信技能树的R语言入门视频,但实际使用时经常会遇到一些问题,这次参加了生信技能树的系统培训班想查漏补缺。这里是整理的第一周学习笔记,主要是针对以前存在的一些问题有了更清晰的认识。...

2023-03-12
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生信技能树 数据框data.frame练习1

生信技能树练习题大全:http://www.biotrainee.com/thread-1754-1-1.html by Jimmy老师

2023-03-11
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数据挖掘第三天(数据结构)

修改行名和列名,其实就是修改向量,要修改全部行名就给全部赋值,如果要改一个列名就给取子集赋值。如:修改第二列的列名,就是修改【列名这个向量】的第二个元素...

2023-03-11
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R基础(二)

In x == y : longer object length is not a multiple of shorter object length

2023-03-09
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数据结构(部分内容)

paste0()和paste()的区别为,paste()函数中有一个参数为sep=" ",意为以空格为间隔组合(默认)。而paste0()是无缝组合。

2023-03-08
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R的数据

可以看出,字符型数据是在双引号或单引号中括起来的内容;数值型就是数字;逻辑型包括三个TRUE,FALSE和NA。

2023-03-08
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R基础(一)

比较运算的结果是逻辑值 < , > , >= ,<= , ==, !=

2023-03-07
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从零开始的异世界生信学习 R语言部分 部分好用的函数

match函数的基本用法a <- c(1,2,3,5,7,20)b <- c(3,8,10)match(a,b)#match (A,B) 其中把A里的元素逐个匹配B中所有元素,如能匹配上,就返回匹配上的元素在B向量的位置;所以返回值长度和A相等match(a,b)#[1] NA NA 1 NA NA ...

2023-03-07
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"站长,Mapping之后counts怎么合并成一个表?"

"少废话,来干货~"将R语言工作环境设置为这些文件所在文件夹注意这些文件夹中不能有其他文件如果你的样本是链特异性(Reverse)测序“啥是链特异性,需要解释的留言”用下面这组命令library(stringr)library(dplyr)fall <- d...

2023-03-02
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“站长,怎么注释基因名字啊?”

ID转换 很多时候你得到的是GENCODE的ID,比如ENSGxxx之类的,怎样转换成gene symbol呢?往下看一般的教程是这样的R语言环境下library("AnnotationDbi")library("org.Hs.eg.db")columns(org.Hs.eg.db) #看一下都有什么resDI...

2023-03-02
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