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Nat. Rev. Drug Discov. | 人工智能在天然产物药物发现领域的应用

今天为大家介绍的是来自Gerard J. P. van Westen, Anna K. H. Hirsch, Roger G. Linington, Serina L. Robinson和Marnix H. Medema团队的一篇药物发现综述。计算组学技术的发展为我们提供了新的方法工具,用以挖掘天然...

2023-11-22
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Iptables NAT:实现网络中转

在本文中,我们将深入解析iptables NAT(网络地址转换)的功能,以及如何使用它进行网络中转。我们会详细解释NAT中使用的PREROUTING、POSTROUTING和OUTPUT链的含义,介绍如何配置DNAT(目标网络地址转换)和SNAT(源网络地址转换),并在...

2023-11-18
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Nat. Methods | 生物图像分析的未来:心智与机器之间的对话

今天为大家介绍的是来自Loïc A. Royer的一篇文章。生物图像分析领域正处于一个重大转型阶段之中,这要归功于成像技术和人工智能的进步。多模态基础模型的出现,类似于大型语言模型(如ChatGPT),但能够理解和处理生物图像,这...

2023-11-14
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Nat. Med. | 成年人的城市生活环境对心理健康的影响

今天为大家介绍的是来自Jiayuan Xu和Gunter Schumann团队的一篇论文。城市居民暴露于许多可能相互结合和相互作用的环境因素,这些因素可能影响心理健康。目前尚未有工作尝试建模城市生活的复杂实际暴露与大脑和心理健...

2023-11-13
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Nat. Med. | 基于视觉和语言的基础模型,用于病理图像分析

今天为大家介绍的是来自James Zou 团队的一篇论文。公开可用的医学图像缺乏注释,成为计算研究和教育创新的主要障碍。与此同时,许多医生在医学Twitter等公共论坛上分享了匿名化的图像和大量知识。在这里,作者利用这些群...

2023-11-08
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Nat. Med. | 基于遗传学原发部位未知癌症的分类和治疗反应预测

今天为大家介绍的是来自Alexander Gusev团队的一篇论文。原发部位未知癌症(Cancer of unknown primary,CUP)是一种无法追溯到其原发部位的癌症,占所有癌症的3-5%。CUP缺乏已建立的靶向治疗方法,导致普遍预后不佳。作者开发...

2023-11-06
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Nat. Commun. | 利用 HDRNet 对不同细胞条件下的蛋白质-RNA 相互作用进行动态表征和解释

本文介绍吉林大学李向涛教授课题组发表在Nature Communications的研究成果,题为“Dynamic characterization and interpretation for protein-RNA interactions across diverse cellular conditions usi......

2023-10-31
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Nat. Comput. Sci. | 基于拓扑表面和几何结构的3D分子生成方法

今天为大家介绍的是来自侯廷军教授团队的一篇论文。计算机辅助药物发现的一个重大挑战是高效地从头设计药物。虽然近年来已经开始有一些针对特定结构的三维分子生成方法,但多数方法并没有完全学习到决定分子形态和结合...

2023-10-24
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Nat. Protoc. | 基于结构的虚拟筛选指南

基于结构的虚拟筛选已经被广泛用于发现各种治疗靶点的活性分子。随着公开的化学品和蛋白质数据集数量和规模的增加,这些数据集中也包含了越来越多的生物活性数据。人工智能尤其是机器学习,包括深度学习,已经成功利用这些...

2023-10-24
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Nat. Comput. Sci. | PBCNet:药物先导化合物优化的人工智能新方法

先导化合物的结构优化(Lead optimization)是药物设计的核心环节,需要通过DMTA(设计-合成-测试-分析)的反复循环来提高化合物活性、特异性、成药性等性质。长期以来,先导化合物的活性优化高度依赖药物化学家的经验以及大量的...

2023-10-24
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