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最佳实践:利用贪婪算法优化企业电脑监控软件任务处理

贪婪算法可是个超级简单又见效的小玩意,对于某些特殊问题来说,简直是神器。说白了,就是帮你把事情弄得更有条理。以优化企业电脑监控软件的任务处理为例,你可以考虑借助贪婪算法,搞定一些基本的任务分派和安排。不过要记得...

2023-09-04
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纳米孔测序SNP与SV检测

将测序数据与参考基因组进行比对之后,得到排序并建立索引的 bam 之后,就可以进行 SV检测了。检测 SV 的工具众多,这里面我们推荐使用 sniffles 与 cuteSV 两款软件来进行处理。...

2023-09-04
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SNP注释

人类基因组测序数据分析得到的变异位点,如 SNV、INDEL 等,只是给出了位点信息,不便于解读。需要经过注释。注释主要包括基因定位、人群频率计算、进化保守性预测、蛋白功能影响预测等分析,才能用于遗传分析和解读。...

2023-09-04
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不同周期性HF程序的对比

如文献[1]所指出,不同PBC-HF程序之间的严格对比是不可能的,原因包括不同的实现方法、不同的优化水平、不同的license类型等。本文对比了几个PBC-HF程序对金刚石3-21G的计算结果。结果先列在下表里,后文再稍微做点分析。...

2023-09-03
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Amesp中隐式溶剂模型的使用

在量子化学计算中,往往需要计算分子在溶液中的性质,这就需要使用到溶剂模型,其主要分为显式溶剂模型和隐式溶剂模型。显式溶剂模型是将具体的溶剂分子排布在溶质分子周围进行计算,耗时较高。而隐式溶剂模型不需要具体的溶...

2023-09-03
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Amesp中基组的使用

Amesp内置了几十种基组,用户可以直接书写基组名称作为关键词来使用,详见手册中的表2。另外一些情况下需要使用混合基组、自定义基组、赝势基组以及辅助基组等,本文将详细介绍这几种情况的使用方法。...

2023-09-03
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Amesp中SCF不收敛的解决办法(修订版)

在使用量子化学软件时基本上都需要进行自洽场(SCF)迭代计算,一些时候会遇到SCF不收敛的情况,在这里将详细介绍Amesp软件中解决SCF不收敛时的办法,其中大多数关键词都是在“>scf”模块中设置。...

2023-09-03
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Amesp中SCF不收敛的解决办法

在使用量子化学软件时基本上都需要进行自洽场(SCF)迭代计算,一些时候会遇到SCF不收敛的情况,在这里将详细介绍Amesp软件中解决SCF不收敛时的办法,其中大多数关键词都是在“>scf”模块中设置。...

2023-09-03
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量子化学软件Amesp简介

Atomic and molecular electronic structure program (Amesp)是由张英峰独立开发的一款GTO框架的闭源免费的量子化学软件,软件由Fortran语言编写,软件网址为www.amesp.xyz。Amesp软件支持多种WFT方法和DFT方法及其一阶...

2023-09-03
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电脑硬件问题解决案例

本文记录了本人遇到的几个电脑硬件问题,以及尝试解决的过程。最终问题都算是解决了,不过也都算是瞎猫碰到死耗子吧,就当作给大家提供点思路吧。抛砖引玉,希望大家也能分享一些自己的案例。...

2023-09-02
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