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生化小课 | 单个范德华相互作用较弱,但结合起来促进折叠

在蛋白质紧密堆积的原子环境中,还有一种类型的弱相互作用可以产生显著影响:范德华相互作用。范德华相互作用是偶极-偶极相互作用,涉及羰基等基团中的永久电偶极子、源自任何原子周围电子云波动的瞬态偶极子,以及一个原子...

2023-09-06
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生化小课 | 极性基团为蛋白质折叠提供氢键和离子对

疏水效应对于稳定构象显然很重要;结构化蛋白质的内部通常是密集的疏水性氨基酸侧链核心。同样重要的是,蛋白质内部的任何极性或带电基团都具有适合氢键或离子相互作用的伙伴。一个氢键似乎对天然结构的稳定性贡献不大,但...

2023-09-06
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生化小课 | 疏水氨基酸远离水的包装有利于蛋白质折叠

在仔细研究弱相互作用对蛋白质稳定性的贡献时,我们发现疏水效应通常占主导地位。纯水含有一个由H2O分子组成的氢键网络。没有其他分子具有水的氢键势能,并且水溶液中其他分子的存在会破坏水的氢键。当水包围疏水性分子...

2023-09-06
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生化小课 | 蛋白质的构象主要是通过弱相互作用来稳定的

稳定性(Stability)是蛋白质保持其原生构象的趋势。天然蛋白质只具有较小的稳定性,即在生理条件下,典型蛋白质的折叠和展开状态的ΔG只有5至65 kJ/mol的范围。一个给定的多肽链理论上可以假定无数构象,因此,蛋白质的未折叠状...

2023-09-06
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如何翻译Markdown文件?-1-难点及解决方案

近期在搭建英文博客-<e-whisper.com>, 需要对现有的所有中文Markdown翻译为英文.

2023-09-01
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【算法题解】 Day25 动态规划

给定一个数字,我们按照如下规则把它翻译为字符串:0 翻译成 “a” ,1 翻译成 “b”,……,11 翻译成 “l”,……,25 翻译成 “z”。一个数字可能有多个翻译。请编程实现一个函数,用来计算一个数字有多少种不同的翻译方法。...

2023-08-31
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【Mol Cell】解析顺式调控密码(二)

顺式调控密码的最小单位——类似于遗传密码的密码子——是转录因子结合位点(TFBS)。转录因子通常包含结构化和进化保守的DNA结合域(DBD),它们识别并结合一个6-12个碱基对的DNA序列,称为转录因子的“基序”。转录因子基序通...

2023-08-29
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【Mol Cell】解析顺式调控密码

生物学的一个主要目标是揭示控制基因在给定基因组和细胞状态下何时以及以何种程度进行转录的顺式调控密码。在这里,我们讨论了影响转录输出如何由DNA序列和细胞环境编码的主要调控层次。首先,我们讨论了转录因子如何以...

2023-08-29
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英语不好能不能学编程?

就像有人不懂日语,也照样能打通很多日文游戏。不懂英语至少会用翻译软件吧?先记住语法和报错最常涉及的那些单词,if 、while 、for 、class 、def 、error 、type 之类,足够你写出完整的程序。英语好不是学习编程的先决...

2023-08-29
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机场杂谈:挥霍 API 和 AIGC

生娃和进厂之后,个人独处时间越发金贵,随之而来的问题就是阅读量难于保障了。过去我的阅读流程是浏览邮件列表、固定的播客、推特等信息源头,根据喜好情况搜集到 Pocket 之类的 Read it later 工具里面。但是现在因为缺...

2023-08-28
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