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课后补充----关于单细胞空间基础分析的代码部分

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2024-08-02
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课前准备---空间基因梯度(STG)

细胞组成和信号传导在不同的生态位中有所不同,这可以诱导细胞亚群中基因表达的梯度。这种空间转录组梯度(STG)是肿瘤内异质性的重要来源,可以影响肿瘤的侵袭、进展和对治疗的反应。肿瘤组织包含异质性细胞群,在复杂的细...

2024-08-01
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课前准备----细胞“communities”

细胞社区(cellular communities)是基于距离中心细胞特定距离范围内不同细胞类型的局部密度区分的组织区域。

2024-07-30
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课前准备----空间转录组hotspot

空间转录组学在描述具有不同细胞组成的主要组织结构域、癌症特征、免疫抑制中心、具有不同临床结果的整个肿瘤生态型或特定药物对抑制肿瘤进展的影响方面的优势。(在WES的研究中,基因分为了免疫正相关、免疫负相关、肿...

2024-07-29
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生物医学研究和临床应用中单细胞RNA-seq数据分析指南

单细胞RNA测序(scRNA-seq)在生物医学研究中的应用,提高了对疾病发病机制的认识,并为新的诊断和治疗策略提供了有价值的见解。随着包括临床样本在内的高通量scRNA-seq数据的扩大,对这些大量数据的分析已经成为进入这一领...

2022-12-08
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关于空间转录组单细胞精度的讨论

作者,Evil Genius周二了, 世界杯占用了一些时间,近期的工作由于疫情的影响几乎没有什么强度,但是呢,我这样的人只是知识的传播者,拥有科研数据需要发文章的研究者才是知识的创造者,更值得大家学习。今天我们来讨论一个问题,关...

2022-12-07
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探索肿瘤微环境中的细胞互作

在多细胞生物中,细胞通过与其他细胞的交流来协调从早期发育到组织和器官成熟的各个方面。当它们不能正常交流时,疾病就会发生。在互作过程中,由细胞表达的配体结合到同源受体上,同源受体通过接收细胞和信号识别从配体细胞...

2022-10-27
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