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空间肿瘤学:将环境生物学转化为临床与肿瘤成纤维细胞的划分

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2024-10-09
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10X Visium(55um)进行高分辨率降维分析

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2024-09-23
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空间分析揭示了肝细胞癌微小残留病中巨噬细胞介导的免疫逃避机制

将单细胞表型数据与空间坐标相结合,以分析非同型细胞之间直接接触的相互作用,将其定义为在25 μm半径内。

2024-09-23
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课程补充----10X官方推荐的scRNA数据call SNV方法

VarTrix uses Smith-Waterman alignment to evaluate reads that map to each known input variant locus and assign single cells to these variants。该过程适用于10x单个细胞基因表...

2024-09-18
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课程补充----关于单细胞空间外显子分析的突变空间微环境解析

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2024-09-16
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个性化分析(原位)---空间转录组微环境(邻域)细胞聚类 + 突变信息

为了衡量iTME异质性的程度,根据14种肿瘤和免疫细胞亚型计算肿瘤的多样性评分。发现所有应答者的多样性得分都很高。将无应答者分为两个不同的亚组,即多样性得分高的亚组和多样性得分低的亚组。...

2024-09-10
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空间转录组合作项目分析示例(四)

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2024-09-09
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课前准备----高通量单细胞分析数据集中的体细胞突变检测

体细胞突变在单细胞分辨率上的表征对于研究癌症进化、克隆嵌合和细胞可塑性至关重要。体细胞突变在单细胞分辨率上的表征对于研究癌症中的遗传异质性和细胞可塑性、非肿瘤组织中的克隆嵌合体以及确定在恶性细胞和表型...

2024-09-08
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课前准备---脑膜瘤异质性和进化的时空机制(空间 + CNV + 蛋白)

从9名患者中切除的10例高级别脑膜瘤(指定为M1-M10)的16例颅内样本进行了临床、组织学和分子分析。

2024-09-07
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单细胞空间多组学分析中的外显子分析部分

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2024-09-04
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