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生信技能树学习笔记1

x1 = read.csv("C:/Users/win10/Desktop/x.csv")

2023-05-10
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文件读写的代码

#3 读取soft.txt>soft <- read.table("soft.txt",header=T,sep="t")>#4 soft的行数列数是什么?列名是什么?>dim(soft)>colname(soft)#5 将soft导出为CSV>write.csv(soft,file="soft.csv"......

2023-03-13
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聚光深圳 | 魏晓锋:生物多样性 体现在城市生活每一处细节

12月2日,由中共深圳市委网信办指导,凤凰网主办的“聚光深圳”国际交流会客厅第三场论坛——《全球气候变化背景下城市生物多样性保护的路径》在线上播出。该活动旨在打造兼具思想性、开放性和影响力的国际化线上交流平...

2023-03-02
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宏基因组简介

Metagenomics is the study of genetic material recovered directly from environmental samples. The broad field may also be referred to as environmental genomics, ...

2023-02-24
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新冠病毒分型和突变分析(SARS-CoV2_ARTIC_Illumina)

备注:docker运行的操作系统,推荐为Linux,windows,macOS系统改下docker可能部分功能(网络)不能正常运行

2023-02-03
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bsub命令如何指定在特定的conda虚拟环境中运行脚本?

目前我发现想要用bsub命令指定在特定的conda虚拟环境中运行脚本有两种办法:1. 在运行目标命令前使用source命令加载虚拟环境。例如下面要运行base环境中的spades.py命令:#BSUB -q 5220r#BSUB -n 1,48#BSUB -J spades_hq...

2023-01-08
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GATK Germline_SNP_INDEL_2.0 分析遗传病(耳聋)

备注:docker运行的操作系统,推荐为Linux,windows,macOS系统改下docker可能部分功能(网络)不能正常运行

2022-12-13
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使用宏基因组的方法快速鉴定新冠病毒SARS-CoV2

备注:docker运行的操作系统,推荐为Linux,windows,macOS系统改下docker可能部分功能(网络)不能正常运行

2022-12-13
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新冠病毒分型和突变分析(SARS-CoV2_ARTIC_Nanopore)

备注:docker运行的操作系统,推荐为Linux,windows,macOS系统下docker可能部分功能(网络)不能正常运行

2022-12-13
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真核生物基因预测

真核生物的开放阅读框不仅含有编码蛋白的外显子,而且还有内含子,并且内含子将开放阅读框分割为若干个小片段。开放阅读框的长度变化范围非常大,因此真核生物的基因预测远比原核生物困难。但是,在真核生物的开放阅读框中,外...

2022-10-25
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