昨天我们介绍的融合基因查询的数据库，可以查询发生基因融合的基因。由于发生了基因融合，所以就相当于形成了新的基因，对于这种基因的功能是什么，昨天的数据库没有介绍。今天我们就来介绍用来查询融合基因功能的数据。...

基因融合指的是两个或者多个基因的部分序列结合到一起形成了一种新的基因。随着高通量测序的发展，我们可以利用二代测序的数据来鉴定出发生在不同疾病当中的融合基因，所以也就出现了很多来寻找融合基因的数据库。今天就...

关于探究的蛋白质相互作用的数据库，之前介绍过STRING就是这样的数据库，为什么很多生信的文章都是使用STRING来探讨基因之间的相互作用关系，主要原因还是STRING支持输入多个基因，寻找多个基因之间的相关作用关系。但是如果...

昨天我们介绍了一些网络分析当中用到的一些基础的知识（相互作用网络分析基础）。对于基因组数据分析而言的话，我们能用到网络分析的就是蛋白相互作用分析(protein-protein ineraction, PPI)分析了。...

偶然间在 youtube 上看到 Dan Knights 的 Microbiome Discovery 宏基因组入门课程，大致浏览了一下，由浅入深，从理论到实践讲得非常不错，真是相见恨晚 QAQ，只看这个应该完全足够入门宏基因组了~...

深度学习三巨头之一、图灵奖获得者 Yann LeCun 看完之后一脸认真地说，「卷积网络正在马桶上落地，为人类谋福祉。」

所以我自己在2019年录制了两套不同层级的单细胞转录组数据分析视频教程，还配套了视频学习笔记，今年（2020）在培养学徒的过程中，我又安排学徒根据这两套视频精炼成为了10个笔记，大家可以在：单细胞转录组数据的个性化分析汇总全...

随着单细胞技术的成熟，测序成本的降低，单细胞的数据量和样本量也日益增长。我们知道单细胞转录组的一个主要应用就是解释细胞的异质性，那么，不同器官，不同测序平台，不同物种之间的单细胞数据何如整合分析呢？特别是在单细胞的...

如果说单细胞转录组数据分析中的分群是寻找细胞的离散属性，那么轨迹推断就是寻找细胞分化连续性的尝试。为什么细胞的分化既有离散性又有连续性呢？这是一个历史问题，细胞的分化当然是连续的，之所以用分群的方法来解释异质...

当你的才华还撑不起你的野心时，请潜下心来，脚踏实地，跟着我们慢慢进步。不知不觉在单细胞转录组领域做知识分析也快两年了，通过文献速递这个栏目很幸运聚集了一些小伙伴携手共进，一起成长。...