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在获得“世界第一”法规批准后,Eat Just在新加坡出售实验室生产的肉

在获得新加坡食品管理局(SFA)的监管批准后,Eat Just将开始在新加坡提供实验室培育的鸡肉。通过与当地制造商合作,这种细胞培养的鸡肉最终将在Eat Just的新好肉品牌下生产出来,并在消费者面前出售给餐馆。虽然还有很多其...

2020-12-04
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GWAS全基因组关联分析流程(BWA+samtools+gatk+Plink+Admixture+Tassel)

我梳理了GWAS全基因组关联分析的整个流程,并提供了基本的命令,用到的软件包括BWA、samtools、gatk、Plink、Admixture、Tassel等,在此分享出来给大家提供参考。...

2020-10-19
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使用Gatk Germline spns-indels Pipeline分析遗传病(耳聋)

这是GATK Best Practice系列学习文章中的一篇,本文尝试使用Gatk Germline spns-indels Pipeline来分析遗传病(耳聋)数据这次没有拿到遗传病的室间质评的

2020-09-11
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《数据可视化基础》两个或多个连续性变量相关可视化(一)

以下部分是基于《Fundamentals of Data Visualization》学习笔记,要是有兴趣的话,可以直接看原版书籍:https://serialmentor.com/dataviz/

2020-08-27
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《数据可视化基础》第11章:两个或多个连续性变量相关可视化(一)

很多数据集里面都包含有两个或者更多的连续性变量,有时候我们比较感兴趣这些变量之间存在什么相互作用关系。例如,我们可能有不同动物的量化测量数据集,如动物的身高、体重、长度和每日能量需求。为了绘制仅仅两个这样的...

2020-08-27
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TCGAG多组学联合分析数据库

之前我们在介绍GEPIA的时候,说这个数据库只能用于TCGA表达数据的一些分析。但是对于TCGA数据而言,里面包括相同样本的表达、突变、拷贝数、甲基化以及临床信息等数据,所以我们其实可以利用TCGA数据库来进行多组学之间的...

2020-08-27
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肿瘤转移相关lncRNA数据库

实验验证的数据库数据库其实和综述差不多。综述是基于一个主题检索相关文献,然后利用文字来进行来进行总结出这些文献的相关特点。而这类经过实验验证的数据库,第一步也是人工来检索相关的文献。第二步则把文献当中的相...

2020-08-27
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(1)分子生物学专业名词

1、细胞周期蛋白:在细胞周期的后期逐渐合成、至周期的中间阶段突然消失的周期性存在蛋白,成为细胞周期蛋白。细胞周期蛋白可分为3类:S期周期蛋白,M期周期蛋白,G1期周期蛋白。S期周期蛋白为cyclin A,在S期开始表达,到中期时开...

2020-08-26
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突变对蛋白功能影响预测

在每个分析开始之前,我们都需要命名一个数据的ID。这个ID可以让我们以后,如果想要继续查看结果的话,直接在Job Queue里面输入ID即可。

2020-06-01
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蛋白功能预测

我们在遇到一些新的蛋白的时候,经常需要去了解这个蛋白的功能。如果是一个新的还没有功能注释的蛋白,一般数据库就用不了了。这个时候就可以使用 NetGo 来对蛋白的序列进行功能注释了。...

2020-06-01
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