不过一直没有使用singleR自己有的celldex数据包里面的参考数据库,所以这期就一起来看看下载需要的celldex参考数据库,以及使用singleR注释的方法。
现在有了高质量的细胞,可以继续工作流程。最终,希望对细胞进行聚类并识别不同的潜在细胞类型,但是在那之前需要完成几个步骤。下面的工作流程示意图中的绿色框对应于QC 后采取的步骤,共同构成了聚类工作流程。...
在命令行运行下面的命令,如果是root帐号,请去除sudo,其他系统参考 > Install R