CNV检测已成为全基因组分析的常规内容，并显著提升了阳性诊断率。然而，由于实验室水平和所使用软件的差异，目前仍难以全面、准确地覆盖CNV的检测与细节分析。尤其在数据分析环节，目前尚无开源软件能够在性能优越的同时，全面...

人瘤病毒阴性（HPV-）头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）是HNSCC的一个主要亚型，与HPV阳性疾病相比，其临床结局较差，对放化疗以及针对EGFR和PD-1的治疗的反应率较低。在超过一半的HNSCCs HPV-中观察到CCND1和CDKN2A畸变介导的细胞周期信...

有几个问题，如果数据没处理完，或者a还没被赋值的时候，save a 会报错，提示找不到a；最后的plot，即是以R内置的iris数据中的两列数据作散点图，出现一个最基础的、x轴y轴一一对应的图像。...

rnorm(n,mean,sd)函数用于从具有特定均值和标准差的正态分布生成n个随机值。

2022年在圣母大学组织的关于网络生物学未来方向的研讨会上，生物网络的推理和比较作为重要的研究方向，越来越多的被用于标记物的筛选与分子机制的研究。最近比较火热的viper实现单细胞蛋白活性推断，也是基于ARACNE算法构...

大家自行去GEO官网(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gds)搜索下载自己想要的单细胞测序数据。本文后面会提供数据用于示例代码测试。

单细胞转录组分析不能局限在基因的差异表达，需要具体到某个生物学功能上来，才能近一步揭示生物学意义。通常进行差异基因的功能富集分析，包括GO、KEGG、REACTOME等数据库。...