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主动学习预测结合自由能进行分子优化

今天给大家介绍的是卡内基梅隆大学的研究团队近期的一篇分子优化工作。识别蛋白质抑制剂通常需要预测配体结合自由能(Binding Free Energy, BFE)。热力学积分(Thermodynamics integration , TI)是一种能够准确预测BFE...

2022-11-28
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J. Med. Chem. | ChemistGA: 一种多目标可合成全新药物设计方法

本文介绍一篇来自浙江大学侯廷军教授和谢昌谕教授课题组、武汉大学陈曦课题组、中南大学曹东升教授课题组和碳硅智慧联合发表的论文。该论文提出了一种全新的生成特定性质的可合成分子生成新方法ChemistGA,该算法将传...

2022-11-28
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基于组合贝叶斯优化的自动化抗体设计

今天给大家介绍的是来自华为诺亚方舟实验室发表在 arxiv 上的预印本《AntBO: Towards Real-World Automated Antibody Design with Combinatorial Bayesian Optimisation》。作者设计了一种组合贝叶斯优化框架 AntBO ...

2022-11-28
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Nat. Mach. Intel. | 利用生成对抗网络重建新陈代谢动力学模型

今天介绍一篇洛桑联邦理工学院Ljubisa Miskovic等人于2022年8月在线发表在Nature Machine Intelligence上的文章《Reconstructing Kinetic Models for Dynamical Studies of Metabolism using Generative ......

2022-11-28
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Cell | 深度突变学习预测SARS-CoV-2受体结合域组合突变对ACE2结合和抗体逃逸的影响

本文介绍一篇来自于苏黎世联邦理工学院的Joseph M. Taft在Cell上发表的工作——《Deep Mutational Learning Predicts ACE2 Binding and Antibody Escape to Combinatorial Mutations in the SARS-CoV-2 R......

2022-11-28
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全球人工智能(AI)在药物发现中的应用市场--行业趋势和2029年预测

全球人工智能(Artificial Intelligence, AI)在药物发现中的应用,按应用(候选新药、药物优化和再利用、临床前试验和批准、药物监测、寻找新的疾病相关靶标和通路、了解疾病机制、聚集和综合信息、形成和鉴定假设、新药...

2022-11-28
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Nat. Commun. | 核酸聚合物生成,机器学习来帮忙

今天给大家介绍哈佛大学David R. Liu课题组在国际期刊nature communications上发表的核酸序列生成的文章《Generating experimentally unrelated target molecule-binding highly functionalized nucleic-acid......

2022-11-28
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KDD 2022 | MolSearch: 基于搜索的多目标分子生成和性质优化

今天介绍一篇由密歇根州立大学Mengying Sun等人于2022年8月在线发表在KDD上的文章。本文基于搜索的方法提出了一个简单而有效的框架,称为MolSearch,用于多目标生成和优化。作者声称,在适当的设计和足够的领域信息的情况...

2022-11-28
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AlphaFold、人工智能(AI)和蛋白变构

AlphaFold 闯入了我们的生活。一种强大的算法,强调了生物序列数据和人工智能(AI))的力量。AlphaFold有附加的项目和研究方向。一直在创建的数据库承诺了无数的应用程序,这些应用程序具有巨大的潜在影响,但仍然难以推测。...

2022-11-28
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KDD '22 | 物理模型增强伪标记的 T 细胞受体-肽相互作用预测

今天介绍一篇来由美国NEC实验室Erik Kruus等人于2022年8月在线发表在KDD上的文章。在这篇文章中,作者团队提出通过TCR-肽对的物理建模来扩展训练集,以解决当前数据集中出现的数据稀缺问题。实验证明,用物理建模和数据增...

2022-11-28
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