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细胞组成和信号传导在不同的生态位中有所不同，这可以诱导细胞亚群中基因表达的梯度。这种空间转录组梯度(STG)是肿瘤内异质性的重要来源，可以影响肿瘤的侵袭、进展和对治疗的反应。肿瘤组织包含异质性细胞群，在复杂的细...
细胞社区（cellular communities）是基于距离中心细胞特定距离范围内不同细胞类型的局部密度区分的组织区域。
空间转录组学在描述具有不同细胞组成的主要组织结构域、癌症特征、免疫抑制中心、具有不同临床结果的整个肿瘤生态型或特定药物对抑制肿瘤进展的影响方面的优势。（在WES的研究中，基因分为了免疫正相关、免疫负相关、肿...
默认情况下，推断CNV在整个样本水平上运行，例如从单个患者中提取的某种细胞类型的所有细胞。这是推断CNV的最快方法，但往往不是最优方法，因为给定的肿瘤样本可能有具有不同CNV模式的亚群。通过设置infercnv::run(analysis ...
