FlowSig使用基因表达值和细胞间通信推断的输出来计算描述定向依赖的细胞间流动。这些依赖关系从流入的细胞间信号指向细胞内的GEM（ gene expression modules），这些GEM可能是单个TF或相关基因集的细胞富集，并从GEM指向流...
腾讯云开发者社区是腾讯云官方开发者社区，致力于打造开发者的技术分享型社区。提供专栏,问答，沙龙等产品和服务，汇聚海量精品云计算使用和开发经验，致力于帮助开发者快速成长与发展，营造开放的云计算技术生态圈。...
空转分析肿瘤样本由于其异质性和混沌性，使得聚类算法难以识别最佳空间区域，识别标记基因和空间niche。
大多数实体瘤起源于上皮细胞，被称为癌，包括胃癌、肺癌、膀胱癌、乳腺癌、前列腺癌和结肠癌，而其他一些实体瘤起源于其他类型的组织，包括肉瘤和黑色素瘤。无论其细胞来源如何，了解恶性细胞的分子特征和细胞异质性对于揭示肿...
染色质、转录因子和基因之间的相互作用产生了复杂的调控回路，可以表示为基因调控网络(gene regulatory nerworks，GRNs)
肝母细胞瘤(HB)通常在5岁前被诊断出来，是最常见的儿科肝脏肿瘤。HB的基因组图谱相对简单，几乎所有肿瘤中都有ß-catenin激活突变，约85%的病例中有11p15.5 imprinted位点的改变，还有十几个其他驱动因素发生低频改变，包括TER...
irGSEA整合了多种基于单个细胞表达等级的富集分析方法(AUCell、UCell、singscore、ssGSEA、JASMINE和Viper)，并通过秩聚合算法(robust rank aggregation, RRA)对差异分析的结果进行评估，筛选出在这种几种方法中表现出相...
空间转录组学领域旨在捕捉组织完整的转录图谱，并将基因表达映射到特定位置，揭示不同细胞类型的空间分布及其分子活性。10x的Visium分析使用barcodes的载玻片捕获和定位转录表达。在Visium HD空间基因表达实验中，barcode...
