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先将 Seurat V5 对象中的 Assay5 类型转换为 Seurat 旧版本中的 Assay 类型，然后再进行转化
SCENIC教程中给出三个方法进行下游的可视化分析，分别可以选择网页(SCope)平台，R或者python进行分析。
将单细胞表型数据与空间坐标相结合，以分析非同型细胞之间直接接触的相互作用，将其定义为在25 μm半径内。
重读上一篇关于monocle3的推文的时候感觉内容冗长繁琐，因此笔者把关键部分代码稍作了整理。
VarTrix uses Smith-Waterman alignment to evaluate reads that map to each known input variant locus and assign single cells to these variants。该过程适用于10x单个细胞基因表...
totipotent(多谱系分化的全能)—pluripotent(多谱系分化的多能)—multipotent(谱系限制分化的多能)—oligopoten(谱系限制分化的寡能)—unipotent(谱系限制分化的单能)—differentiated(分化)...
CCA（Canonical Correlation Analysis）和 Harmony 是两种常用于单细胞 RNA 测序（scRNA-seq）数据整合和批次效应校正的方法。
