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R语言学习笔记-Day 1

利用脚本编辑器储存代码,可重复运行。可选择逐行运行或选中多行运行(“shift”)

2024-07-01
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day 10 GSVA和CellChat

腾讯云开发者社区是腾讯云官方开发者社区,致力于打造开发者的技术分享型社区。提供专栏,问答,沙龙等产品和服务,汇聚海量精品云计算使用和开发经验,致力于帮助开发者快速成长与发展,营造开放的云计算技术生态圈。...

2024-07-01
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day9 二次分群和细胞周期

如果是大多数点都集中在0点附近的,就可以不用去除细胞周期的影响!,分布范围较广或者是有较多的离群值那就需要要去除。

2024-07-01
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day 8 拟时序分析

做拟时序分析通常不是拿全部的细胞,而是拿感兴趣的一部分。用subset提取子集即可。因为要使用差异基因来排序,所以要两类及以上细胞。例如下面选择NK和CD8 T细胞;如果只做一类细,就需要二次分群(后面介绍)...

2024-07-01
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day7 GEO下载多样本数据的聚类注释

腾讯云开发者社区是腾讯云官方开发者社区,致力于打造开发者的技术分享型社区。提供专栏,问答,沙龙等产品和服务,汇聚海量精品云计算使用和开发经验,致力于帮助开发者快速成长与发展,营造开放的云计算技术生态圈。...

2024-07-01
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转录组测序分析

通过单分子阵列实现在小型芯片(Flowcell)上进行 桥式PCR反应。通过可逆阻断技术实现每次只合成一个碱基,再利用四种带有不同荧光标记的碱基,通过荧光激发/捕获,读取碱...

2024-06-27
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Linux软件安装与脚本编程

wget -c https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

2024-06-26
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单细胞学习第七天

单细胞数据的GSVA和芯片、bulk转录组的GSVA没有本质区别,就使用AverageExpression获取平均表达量得到新的表达矩阵再计算即可。

2024-06-23
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单细胞学习第六天

Seurat里的FindClusters函数设置的resolution数值越大,分群的数量就越多,但是当单细胞数量太多的时候,会遇到resolution再变大,分群的数量也不再增加的情况。一次分群分不开,但又想要细分时,就会需要二次分群,其实就是细胞亚...

2024-06-22
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单细胞学习第五天

今天的学习内容是单样本的拟时序分析。花花给我们科普了拟时序的基本概念和用途,这个很有用,必须记录。

2024-06-21
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