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J. Med. Chem. | 用图形注意机制推进药物发现分子表征的边界

今天给大家介绍的是上海科技大学免疫化学研究所蒋华良院士团队在Journal of Medicinal Chemistry上发表了一篇名为“Pushing the Boundaries of Molecular Representation for Drug Discovery with the Graph Attent....

2021-02-04
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BIB|基于机器学习的药物与靶点相互作用预测方法综述

近年来,药物科学家一直高度关注依赖于现有药物知识的新型药物开发策略。事实上,药物发现任务的困难在于已知的药物与基因相互作用位点的了解不充分,而主要风险在于药物与靶点的即副作用。尽管这些副作用大多数有害的,但有...

2021-02-04
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BIB | 基于注意力机制的图卷积网络预测药物-疾病关联

今天给大家介绍华中农业大学章文教授团队在Briefings in Bioinformatics上发表的文章“Predictingdrug–disease associationsthrough layer attention graph convolutional network”。确定药物与疾病的关联是药物开...

2021-02-04
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CELL SYST|多目标神经网络框架预测化合物-蛋白相互作用和亲和力

这次给大家介绍清华大学交叉信息研究院的曾坚阳教授课题组在Cell Systems上发表的论文“MONN: A Multi-objective Neural Network for Predicting Compound-Protein Interactions and Affinities”。分析化合物与蛋白...

2021-02-04
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写给 Linux 初学者的一封信

这篇文章是写给 Linux 初学者的,我会分享一些作为初学者应该知道的一些东西,这些内容都是本人从事 Linux 开发工作多年的心得体会,相信会对初学者有所帮助。如果你是 Linux 老鸟,那可能就不需要再往下看啦...

2021-02-04
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TCBB|基于多视角图嵌入学习模型识别蛋白质折叠结构

今天给大家介绍北京理工大学刘滨教授和哈工大(深圳)徐勇教授团队在“IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics“上发表的工作 “Protein Fold Recognition Based on Auto- Weighted Mult......

2021-02-02
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2021年战胜机器学习纸老虎-第二周 决策树(一)

大家好,很高兴来到了2021年战胜机器学习纸老虎-第二周 决策树(一)的内容时间。我一步一步从简单的例子,进入机器学习的世界。(PPT大小限制,压缩了会变形,就一页一页贴吧)...

2021-02-01
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Bioinformatics| 生物医学网络中的图嵌入方法

今天给大家介绍Bioinformatics期刊的一篇文章,“Graph embedding on biomedical networks: methods, applications and evaluations”。文章研究了图嵌入方法在生物医学网络分析上的应用,来自美国俄亥俄州立大学、美国...

2021-02-01
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万里长征,始于足下——菜鸟程序员的学习总结(三)

上面学习总结(一)、(二)的博客也都是关于学习方法的。那些是在CS阶段总结的学习方法,当然对于BS阶段也同样适用。每个阶段有每个阶段的特点,只要我们细心观察总能找到更多的相同点和不同点。相同点很多,不同点很少,下面的有些...

2021-01-29
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万里长征,始于足下——菜鸟程序员的学习总结(二)

最近一直的开技术交流会,技术交流会的内容涉及到了B/S学习的所有内容,开会的过程中涉及最多的学习方法和技巧。

2021-01-29
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