课前准备
为什么是R不是EXCEL、SPSS
- R主要的功能是数据处理、数据可视化，且相对易学
- excel、spss也可以实现大部分功能且更简单，但是R是使用代码来进行操作。操作的步骤、结果相比窗口化、鼠标点击的方式可重复性更强 - （想起了以前用spss处理数据的日子，变量多的时候，都放了哪些协变量，甚至分类变量里用谁当ref都记不太清了，确实也闹过乌龙···
- excel单元格格式更复杂，可能会有不必要的麻烦R语言的功底很重要的
- 之前学习孟德尔随机化的时候对于会不会读代码有一些简单的体会：不会读代码的话只能根据别人给的代码来很机械的实现功能，需要实现一些其他的功能就很麻烦，甚至需要去excel手动调整数据，然后再跑代码···
- 还有就是代码的效率？目前没遇到过，但是听说过不同的代码算法会很影响效率项目管理思维
- 习惯用project管理数据、代码 - 先建立project然后再建立script，方便管理资料，且不易混乱学习别人的经验很重要
和R语言进行交互后输出内容的类型
- 顺利运行：输出结果、图片、>大于号
- Error
- Warning
- 卡住不动
- 出现 加号（表明代码不全，需要补全或按ESC退出
- 出现提示信息
- 需要回复，需要进一步选择（y/n）抓大放小，只关注关键的问题--能跑起来就行（bushi
数据类型
- 数值型，numeric，eg 纯数字、赋值之后的字母
- 字符型，character，所有带引号的
- 逻辑型，logical， T、F、NA三种 - 常出现的位置 - 比较运算“<,>,<=,>=,== ,!=”；注 == 是比较运算，= 是赋值 - 逻辑运算，与&，或｜，非！
- 可用class函数判断
- is. 函数查询；as. 函数可进行数据类型转换（会用到
tips
- 防止写错代码，学会使用自动补齐（出现提示后按 Enter or Tab Tab补齐很强大，不止可以补齐代码，还可以自动写一些变量、参数、文件名。可以很大程度的减少拼写导致的错误
- 代码报错不全是代码写错了，也可能是文件位置不对、函数使用、数据类型等问题 - 不要害怕debug，仔细看报错提示，不行就复制去翻译、去Google 或者群里求助 - 常见报错
- 判断数据类型很重要，是R运算的基础，应该慢慢建立这种思维
图片引用自生信技能树
