​生信星球--生信入门DAY1

2024-01-17 21:52:44 浏览数 (1)

Linux操作系统

Linux 是一种自由和开放源码的类 UNIX 操作系统。 Linux 英文解释为 Linux is not Unix。

Linux 是在 1991 由林纳斯·托瓦兹在赫尔辛基大学上学时创立的,主要受到 Minix 和 Unix 思想的启发。

R语言

R 语言是为数学研究工作者设计的一种数学编程语言,主要用于统计分析、绘图、数据挖掘。

R语言与C语言

R 语言与 C 语言都是贝尔实验室的研究成果,但两者有不同的侧重领域,R 语言是一种解释型的面向数学理论研究工作者的语言,而 C 语言是为计算机软件工程师设计的。

两者优劣

R 语言是解释运行的语言(与 C 语言的编译运行不同),它的执行速度比 C 语言慢得多,不利于优化。但它在语法层面提供了更加丰富的数据结构操作并且能够十分方便地输出文字和图形信息,所以它广泛应用于数学尤其是统计学领域。

GEO数据库

GEO数据库全称GENE EXPRESSION OMNIBUS,是由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库。它创建于2000年,收录了世界各国研究机构提交的高通量基因表达数据,也就是说只要是目前已经发表的论文,论文中涉及到的基因表达检测的数据都可以通过这个数据库中找到。关键是这个数据是免费的!

NCBI Gene Expression Omnibus(GEO)作为各种高通量实验数据的公共存储库。这些数据包括基于单通道和双通道微阵列的实验,检测mRNA,基因组DNA和蛋白质丰度,以及非阵列技术,如基因表达系列分析(SAGE),质谱蛋白质组学数据和高通量测序数据。

代码语言:R复制
A=1

在GEO最基本的组织层面,有四种基本实体类型。前三个(样本,平台和系列)由用户提供; 第四,数据集由GEO工作人员根据用户提交的数据进行编译和策划。

(暂时实在写不出什么代码 纯粹的freshman)

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