Linux系统转录组上游泳分析：Day2依芙

基础操作

代码语言：Linux复制

cd  pwd- ls-

三驾马车

grep

代码语言：Linux复制

wc -l
-v ‘SRR’  #带有SRR的除外

sed

代码语言：Linux复制

sed -n 显示所有输入内容。只显示经过sed处理的行
sed -e 同时执行多个命令
sed -f 值型全部由sed动作的文件
sed -r sed的动作支持的正则

awk

代码语言：Linux复制

awk ‘{print}’   #批量生成脚本

切片

cut

代码语言：Linux复制

cut -d "|" -f "-6" #指定 | 为分隔符，切第六列

unique

paste

代码语言：Linux复制

paste - - - - #将四行合并为1行

echo

代码语言：Linux复制

echo $PATH #打印环境变量PATH

正则表达式（待补全）

代码语言：Linux复制

‘f?ee’ 寻找位于行首的ee，ee前出现f的次数可为0或1次

作业

代码语言：Linux复制

ls -l 输出长格式列表
uname -a 查看Linux系统版本
df -hT 查看空间
mkdir -p ./workspace/tb/positive 建立层级目录
rm -r /software 删除目录

数据挖掘 生物基因

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