Linux的应用商店——conda Day3依芙

Miniconda的下载安装

1.下载

wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.shLinux

2.安装

bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

可以按q跳过内容，遇见yes打“yes”

3.配置

代码语言：Linux复制

source ~/.bashrc` 重启bashrc文件 **注意/.的相对位置**
vi .condarc 是在家目录下新建

使用北外的镜像^1

代码语言：Linux复制

conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes

source ~/.condarc 依然注意/.的相对位置

4.软件下载

conda install xxxxx 如果出现了该软件的帮助文档，则为成功

下载前可以先用conda search fastQC 检查channel中是否有该软件

其他相关命令

代码语言：Linux复制

conda env list 查看环境列表
conda create -n rna version==3.10 新建一个叫rna的环境，指定python版本为3.10
conda activate rna 激活该环境
conda deactivate rna 失活该环境

undefined

数据挖掘 生物基因

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