安装conda--linux 的应用商店
anaconda=miniconda 150 high quality packages=conda Python base packages
安装步骤
搜索“miniconda 清华”复制下载链接
代码语言：english复制cd biosoft/
wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh #安装
source ~/.bashrc #激活conda添加镜像
代码语言：english复制conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes使用conda
代码语言：english复制conda list #查看安装的软件
conda install fastqc -y #安装软件fastqc
conda install r #安装软件r
conda install plink #安装软件plink
plink --help #查看是否安装成功conda 环境
代码语言：english复制conda info --envs
conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y #建立rnaseq的conda环境，指定python版本是3，安装软件fastqc、trimmomatic（这两个可以一步完成）
conda activate rna-seq #激活新的conda环境
conda deactivate #退出当前环境
