生信学习第三天
1 生信软件的安装
2 具体安装步骤
2.1 百度搜索清华镜像下的安装链接=》进入:
https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/
安装linux下面有64-bit(x86_64)的最新版本,复制链接,如https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-4.5.11-Linux-x86_64.sh
后登录服务器
代码语言:linux复制cd ~/biosoft#进入biosoft路径,过程中可以使用Tab补齐功能,避免输错
wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-4.5.11-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
source ~/.bashrc#激活
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes#复制代码后回车,注意理解代码意思
conda list#开始使用conda
conda install fastqc -y
fastqc --help#确认是否安装成功