R包
多个函数的打包存放
相应的R包可实现特定的分析功能
R包包含函数、数据、帮助文件、描述文件
安装
R包来源有CRAN、Bioconductor、GitHub
代码语言:{r}复制install.packages(tidyr)#CRAN
BiocManager::install("limma")#Bioconductor
devtools::install_github("jmzeng1314/idmap1")
library("tidyr")#加载
devtools::install_local(“xxxx.zip”)#本地安装
安装后每次使用都要先加载,也可用来检验是否成功安装 载入包时回答提示信息尽量no*
已经安装的包,可直接调用其中的函数
代码语言:{r}复制pheatmap::pheatmap(volcano)#包名::函数名
library(pheatmap)
pheatmap(volcano)
学习R包的使用
代码语言:{r}复制browseVignettes("limma") #作者一手教程,不是每个包都有
ls("package:limma")#列出包中的函数等
引用自生信技能树 小洁老师