生信学习小组day7土

2023-07-03 02:08:16 浏览数 (1)

1.基因组学(核酸序列分析)

(1)全基因组测序(WGS)

(2)全外显子组测序(WES)

(3)简化基因组测序(RRGS)

      ①RAD-Seq

      ②GBS

      ③2bRAD

      ④ddGBS(也就是ddRAD)

作用:

(1)基因组作图(遗传图谱、物理图谱、转录本图谱)

(2)核苷酸序列分析

(3)基因定位

(4)基因功能分析

其它:

以全基因组测序为目标的结构基因组学

以基因功能鉴定为目标的功能基因组学

2.转录组学(基因表达分析)

(1)mRNA-Seq

(2)IncRNA-Seq(长链非编码RNA)

(3)sRNA-Seq(主要是miRNA-Seq)

作用:

(1)获得物种或者组织的转录本信息

(2)得到转录本上基因的相关信息,如基因结构功能等

(3)发现新的基因

(4)基因结构优化

(5)发现可变剪切

(6)发现基因融合

(7)基因表达差异分析

3.蛋白质组学

(1)蛋白质组数据处理、蛋白及其修饰鉴定

   (2)构建蛋白质数据库、相关软件的开发和应用

   (3)蛋白质结构功能预测

   (4)蛋白质连锁图

4.代谢组学

(1)代谢物指纹分析

(2)代谢轮廓分析

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