Day6——查布铎徳勒

2023-07-22 18:14:30 浏览数 (1)

软件管理Miniconda

生信方面小而精的软件下载器

将miniconda下载到服务器上

代码语言:txt复制
搜索‘Miniconda 清华’
进入  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/ 
查看服务器多少位: uname -a
安装最新版本
复制链接
进入“biosoft”目录: cd ~/biosoft
wget ‘复制的链接’

安装miniconda

代码语言:txt复制
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
sourse ~/.bashrc #激活

添加镜像:conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/ conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/

conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/

conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/

conda config --set show_channel_urls yes

使用conda

  1. conda list 查看安装软件
  2. conda install fastqc —y 安装软件
  3. fastqc ——help 查看是否安装成功
  4. conda remove fastqc —y 卸载软件

0 人点赞