软件管理Miniconda
生信方面小而精的软件下载器
将miniconda下载到服务器上
代码语言:txt复制搜索‘Miniconda 清华’
进入 https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/
查看服务器多少位: uname -a
安装最新版本
复制链接
进入“biosoft”目录: cd ~/biosoft
wget ‘复制的链接’
安装miniconda
代码语言:txt复制bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
sourse ~/.bashrc #激活
添加镜像:conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/ conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes
使用conda
- conda list 查看安装软件
- conda install fastqc —y 安装软件
- fastqc ——help 查看是否安装成功
- conda remove fastqc —y 卸载软件