D7-测序原理-张三

2023-07-24 10:17:34 浏览数 (1)

一代测序-sanger测序

主要通过合成dna时, ddNTP阻断dna的合成,利用放射性ddNTP通过凝胶电泳分离和放射自显影来读取序列。

特点:长(1000bp),准确性高(99.999%),通量低

二代测序-NGS

边合成变测序(sequence by synthesis, SBS)

利用荧光标记dNTP在合成时不同的荧光通过捕捉荧光信息经过特定计算机软件处理获得待测序列。

代码语言:txt复制
构建DNA文库
上样#待测序列自带了p5接头和p7接头
桥式PCR#序列补成双链、去杂、桥式形成、桥式PCR、循环、解链
测序
双端测序

特点:通量高、时间短、读长短

三代测序

单分子实时DNA测序

DNA测序时不需要经过PCR扩增,实现对每一条DNA分子的单独测序。

SMRT技术

纳米孔单分子测序技术

NGS组学分类

1.基因组学(核酸序列分析)

代码语言:txt复制
全基因组测序(WGS)
全外显子组测序(WES)
简化基因组测序(RRGS)

2.转录组学(基因表达分析)

代码语言:txt复制
mRNA-Seq
IncRNA-Seq(长链非编码RNA)
sRNA-Seq(主要是miRNA-Seq

3.蛋白质组学

4.代谢组学

0 人点赞