今天是学习小组学习的第5天，主要是学习了解R语言的数据结构
1. 新手笔记
R语言赋值符号是<-
R代码带英文括号
函数getwd()获取工作路径
R语言的向量数据结构由元素构成，元素可以是数字或字符串
我们熟悉的表格在R语言的数据结构是数据框
？加上函数可以查看相关的帮助文档
R语言的常用数据类型： 向量、矩阵、数组、数据框和列表
其中向量和数据框是重点
2. 向量
a. 向量的定义和构建
标量是由一个元素组成的变量；而向量则由多个元素组成
使用向量一般给变量赋值；向量有以下四种创建方式
代码语言：txt复制x<- c(1,2,3) #最常用，c创建几个元素构成的向量
x<- 1:10 #：构建从1-10之间所有的整数
x<- seq(1,10,by = 0.5) #构建从1-10之间所有的整数，步长0.5
x<- rep(1:3,times=2) #重复两次1到3的整数b. 从向量中提取元素
(1)根据元素位置
代码语言：txt复制x[4] #提取第4个元素
x[-4] #去除第4个元素
x[2:4] #提取第2到4个元素
x[-(2:4)] #去除第2-4个元素
x[c(1,5)] #提取第1个和第5个元素(2) 根据逻辑值
代码语言：txt复制x[x==10] #提取等于10的元素
x[x<0] #提取小于0的元素
x[x %in% c(1,2,5)] #存在x中在向量c（1，2，5）中存在的元素3. 数据框
tip：运行项目时需要将文件放置于工作目录下；R中严格区分大小写；改错变量可以重新赋值覆盖；可以使用并保存脚本文件，文件格式为R
a. 读取本地数据
代码语言：txt复制a <- read.table(file = 'huahua.txt', sep = 't',header = T) #read.table函数读取文件，sep表示分隔符，header指示文件是否包含变量的名称作为其第一行b. 设置行名和列名
代码语言：txt复制colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默认值行名是行号
colnames(X)[1]<-"bioplanet" #如果左上角第一格为空，R会自动补为x,可以用这个命令来修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1) #row.names的意思是第一列作为行名c. 导出数据框
代码语言：txt复制write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F) #write.table导出，分隔符改为逗号，quote设置字符串不加双引号d. 保存变量和重新加载
代码语言：txt复制#保存变量和重新加载可以让没有处理完的数据下次想接着用，保存格式时RData
save.image(file="bioinfoplanet.RData") #保存当前所有变量
save(X,file="test.RData") #保存其中一个变量
load("test.RData") #加载RData，导入保存的变量e. 提取元素
代码语言：txt复制X[x,y] #第x行第y列
X[x,] #第x行
X[,y] #第y列
X[y] #第y列,有列名
X[a:b] #第a列到第b列
X[c(a,b)] #第a列和第b列
X$列名#也可以提取列,可以用tab补齐，但只能获取一列f. 直接使用数据框变量
代码语言：txt复制plot(iris$Sepal.Length,iris$Sepal.Width) #iris是R中的一个内置数据集数据框，可以直接使用，提取其中两列作散点图save(X,file="test.RData")如果代码报错object X not found，说明X不存在，R找不到这个对象，需要建立X这个变量给他赋值
代码示例来自微信公众号生信星球
